RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477334.1

RBM39-231, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 949 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-231	ENST00000477334	ACTR8	Q9H981	624 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	EXOSC3	Q9NQT5	275 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	C1orf123	Q9NWV4	160 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	VNN3	Q9NY84	501 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	DUSP12	Q9UNI6	340 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	MOK	Q9UQ07	419 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	AP1M2	Q9Y6Q5	423 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	GRIN2D	O15399	1336 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334		A8MU10	97 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334		E9PMD0	336 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	SGK494	L7N484	410 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	RASGRF2	O14827	1237 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	NUDT21	O43809	227 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	HEXB	P07686	556 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	ANXA4	P09525	319 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	IGHV1-2	P23083	117 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	ZBTB25	P24278	435 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	HTD2	P86397	168 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	PRKCE	Q02156	737 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	SPP2	Q13103	211 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	TFDP1	Q14186	410 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	CEBPE	Q15744	281 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	CAMK4	Q16566	473 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	GLYR1	Q49A26	553 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	RAET1G	Q6H3X3	334 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	GALNT17	Q6IS24	598 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	VPS36	Q86VN1	386 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	ADAMTS16	Q8TE57	1224 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	ELMO2	Q96JJ3	720 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	MAPKAP1	Q9BPZ7	522 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	DPM3	Q9P2X0	92 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	MET	P08581	1390 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	RGSL1	A5PLK6	1076 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	RNF222	A6NCQ9	220 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	PDXK	O00764	312 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	TNFSF11	O14788	317 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	TM9SF1	O15321	606 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	JCHAIN	P01591	159 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	RRAS	P10301	218 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	FUT1	P19526	365 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	CCNA2	P20248	432 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	GPC3	P51654	580 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	KIAA0040	Q15053	153 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	CYBRD1	Q53TN4	286 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF677	Q86XU0	584 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	C9orf40	Q8IXQ3	194 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	UBQLNL	Q8IYU4	475 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	GPR137C	Q8N3F9	429 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	CNNM3	Q8NE01	707 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	C14orf79	Q96F83	325 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	VPS39	Q96JC1	886 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	TSGA13	Q96PP4	275 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	DPH5	Q9H2P9	285 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	NGB	Q9NPG2	151 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	POLE3	Q9NRF9	147 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	AURKC	Q9UQB9	309 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	CLCA3P	Q9Y6N3	262 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	USP6	P35125	1406 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	FAM220BP	B1ANY3	271 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334		E7ENQ6	273 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	ATP8B3	O60423	1300 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	SMPD2	O60906	423 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	TOM1L1	O75674	476 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	IGHD	P01880	384 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	CA3	P07451	260 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334		P0C879	139 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	NF2	P35240	595 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	CAMLG	P49069	296 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	CYP51A1	Q16850	503 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	ERAS	Q7Z444	233 aa		3.06	□□□□□ -1.92

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