RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 POLE4Q9NR33 117 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 ZFP57Q9NU63 452 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 CA5BQ9Y2D0 317 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 NPTNQ9Y639 398 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 SMIM1B2RUZ4 78 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 HHLA1C9JL84 531 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 NPIPB9F8W1W9 429 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 K7ERI5 159 aa5.13□□□□□ -1.59
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RABGGTB-209ENST00000473406 LRATO95237 230 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 H2BFMP0C1H6 154 aa5.13□□□□□ -1.59
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RABGGTB-209ENST00000473406 NMT1P30419 496 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 SSR1P43307 286 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 TSFMP43897 325 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
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RABGGTB-209ENST00000473406 DHODHQ02127 395 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 ENPEPQ07075 957 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP5.13□□□□□ -1.591e-6■■■■□ 22.3
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RABGGTB-209ENST00000473406 LCE1DQ5T752 114 aa5.13□□□□□ -1.59
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RABGGTB-209ENST00000473406 OFCC1Q8IZS5 231 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 CLEC4FQ8N1N0 589 aa5.13□□□□□ -1.59
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RABGGTB-209ENST00000473406 OR51G2Q8NGK0 314 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 CNIH3Q8TBE1 160 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 C10orf35Q96D05 121 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC6A7Q99884 636 aa5.13□□□□□ -1.59
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RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM121Q9BTD3 319 aa5.13□□□□□ -1.59
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RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
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RABGGTB-209ENST00000473406 HOXC10Q9NYD6 342 aa5.13□□□□□ -1.59
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RABGGTB-209ENST00000473406 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa5.13□□□□□ -1.59
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RABGGTB-209ENST00000473406 C15orf61A6NNL5 157 aa5.12□□□□□ -1.59
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RABGGTB-209ENST00000473406 RGS1Q08116 209 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 C1orf61Q13536 156 aa5.12□□□□□ -1.59
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RABGGTB-209ENST00000473406 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP5.12□□□□□ -1.59
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RABGGTB-209ENST00000473406 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
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RABGGTB-209ENST00000473406 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 NT5DC2Q9H857 520 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 SEC14L4Q9UDX3 406 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 ALG6Q9Y672 507 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 PNPLA6Q8IY17 1366 aa5.12□□□□□ -1.59
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