RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469757.1

TRAPPC3-206, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC3, Length 221 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-206ENST00000469757 METTL21CQ5VZV1 264 aa7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 PAOXQ6QHF9 649 aa7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 TRILQ7L0X0 811 aa7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZAR1Q86SH2 424 aa7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 SPPL2CQ8IUH8 684 aa7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 FAM26EQ8N5C1 309 aa7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 TRIML2Q8N7C3 387 aa7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 WDSUB1Q8N9V3 476 aa7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR52N2Q8NGI0 321 aa7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 RFWD2Q8NHY2 731 aa7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 FBXO30Q8TB52 745 aa7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 GPR151Q8TDV0 419 aa7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 TSPEARQ8WU66 669 aa7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 PIK3R3Q92569 461 aa7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 SLC9A6Q92581 669 aa7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 JADE3Q92613 823 aa7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 CDS1Q92903 461 aa7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 DTNBP1Q96EV8 351 aa7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 C16orf58Q96GQ5 468 aa7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR52E6Q96RD3 313 aa7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 PANX1Q96RD7 426 aa7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 SLC35A5Q9BS91 424 aa7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 INPP5KQ9BT40 448 aa7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR2B2Q9GZK3 357 aa7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 RABEP2Q9H5N1 569 aa7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 POLE3Q9NRF9 147 aa7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 SLC6A13Q9NSD5 602 aa7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 KLRF1Q9NZS2 232 aa7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 FLRT3Q9NZU0 649 aa7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 NPIPA1Q9UND3 350 aa7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 TRIM33Q9UPN9 1127 aa7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 LIPGQ9Y5X9 500 aa7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 DSPPQ9NZW4 1301 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 HECTD1Q9ULT8 2610 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 A0A096LPI6 279 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 C7orf72A4D263 438 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 CCDC154A6NI56 674 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 DUXAA6NLW8 204 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 RFXANKO14593 260 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 CFLARO15519 480 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 SEMA7AO75326 666 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 LDLRP01130 860 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 CELA3AP09093 270 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 BMP2P12643 396 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 CAPN3P20807 821 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 TBXA2RP21731 343 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 MASP1P48740 699 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 TRPC1P48995 793 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 PRKAG1P54619 331 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 RPS26P62854 115 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 HSF1Q00613 529 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 GANABQ14697 944 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 GRAMD1BQ3KR37 738 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 C6orf120Q7Z4R8 191 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 PLCZ1Q86YW0 608 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 MISPQ8IVT2 679 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR5D16Q8NGK9 328 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR1J4Q8NGS1 313 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 NEIL3Q8TAT5 605 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 FAM57AQ8TBR7 257 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 ADAMTS15Q8TE58 950 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZFP90Q8TF47 636 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 C10orf82Q8WW14 230 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 GTF2H4Q92759 462 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 ITCHQ96J02 903 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR7D2Q96RA2 312 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 RTN4RQ9BZR6 473 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 RMND5AQ9H871 391 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 UBQLN4Q9NRR5 601 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 KLHL14Q9P2G3 628 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 DCTN4Q9UJW0 460 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 PCDHGB4Q9UN71 923 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 SLC5A6Q9Y289 635 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 COL12A1Q99715 3063 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 A0A0G2JND7 137 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 A0A1B0GTH9 108 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 A0A1B0GUH1 482 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 A0A1W2PP18 115 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 HMGN4O00479 90 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 BCKDKO14874 412 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 SLC22A2O15244 555 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 DNAJA2O60884 412 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 CBR3O75828 277 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 KRT75O95678 551 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 GDF1P27539 372 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 SRD5A2P31213 254 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 PTGS2P35354 604 aa7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms