RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458294.5

PBRM1-218, Transcript of polybromo 1, humanhuman

TSL 3

Gene PBRM1, Length 476 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1-218ENST00000458294 PTH2RP49190 550 aa23.71■■□□□ 1.39
PBRM1-218ENST00000458294 CLK3P49761 638 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
PBRM1-218ENST00000458294 CLDN20P56880 219 aa23.71■■□□□ 1.39
PBRM1-218ENST00000458294 PPP2R2BQ00005 443 aa23.71■■□□□ 1.39
PBRM1-218ENST00000458294 STX5Q13190 355 aa23.71■■□□□ 1.39
PBRM1-218ENST00000458294 DECR1Q16698 335 aa23.71■■□□□ 1.39
PBRM1-218ENST00000458294 TEX35Q5T0J7 233 aa23.71■■□□□ 1.39
PBRM1-218ENST00000458294 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa23.71■■□□□ 1.39
PBRM1-218ENST00000458294 OR5M1Q8NGP8 315 aa23.71■■□□□ 1.39
PBRM1-218ENST00000458294 DCAKDQ8WVC6 231 aa23.71■■□□□ 1.39
PBRM1-218ENST00000458294 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
PBRM1-218ENST00000458294 SIRT5Q9NXA8 310 aa23.71■■□□□ 1.39
PBRM1-218ENST00000458294 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
PBRM1-218ENST00000458294 AP4B1Q9Y6B7 739 aa23.71■■□□□ 1.39
PBRM1-218ENST00000458294 JMJD1CQ15652 2540 aa23.7■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 MYO1GB0I1T2 1018 aa23.7■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa23.7■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 PPP3CBP16298 524 aa23.7■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 DDCP20711 480 aa23.7■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 ETF1P62495 437 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 C22orf34Q6ZV56 151 aa23.7■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 TMEM237Q96Q45 408 aa23.7■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 EBPLQ9BY08 206 aa23.7■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 RTN4RQ9BZR6 473 aa23.7■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 KLHL4Q9C0H6 718 aa23.7■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 Q9N2J8 555 aa23.7■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 FLRT3Q9NZU0 649 aa23.7■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 HEATR5AQ86XA9 2040 aa23.7■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 PAX1P15863 534 aa23.69■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 HTR6P50406 440 aa23.69■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 SGCBQ16585 318 aa23.69■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 BEX5Q5H9J7 111 aa23.69■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 SYT10Q6XYQ8 523 aa23.69■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 DUSP19Q8WTR2 217 aa23.69■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 IGFBPL1Q8WX77 278 aa23.69■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 MDFIQ99750 246 aa23.69■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 GRID1Q9ULK0 1009 aa23.69■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 CCDC151A5D8V7 595 aa23.68■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 TMCC2O75069 709 aa23.68■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 PSMG1O95456 288 aa23.68■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 IL33O95760 270 aa23.68■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 JUNP05412 331 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 ENO1P06733 434 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP23.68■■□□□ 1.387e-6■■■■□ 22.1
PBRM1-218ENST00000458294 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF763Q0D2J5 394 aa23.68■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 ANKRD34AQ69YU3 496 aa23.68■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 TMEM107Q6UX40 140 aa23.68■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 OR6K3Q8NGY3 331 aa23.68■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa23.68■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 STOML1Q9UBI4 398 aa23.68■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 EMC9Q9Y3B6 208 aa23.68■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 HIVEP2P31629 2446 aa23.68■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa23.67■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 SERTM1A2A2V5 107 aa23.67■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 INAFM1C9JVW0 142 aa23.67■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 AQP8O94778 261 aa23.67■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 IMPDH1P20839 514 aa23.67■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 PKNOX1P55347 436 aa23.67■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 C17orf67Q0P5P2 114 aa23.67■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 C2orf80Q0P641 193 aa23.67■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 LCP2Q13094 533 aa23.67■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 MARCH3Q86UD3 253 aa23.67■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 LCA5Q86VQ0 697 aa23.67■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 OR2L13Q8N349 312 aa23.67■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 TMEM171Q8WVE6 324 aa23.67■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 MIEF1Q9NQG6 463 aa23.67■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 TAS2R7Q9NYW3 318 aa23.67■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 TMEM216Q9P0N5 145 aa23.67■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 PCNX3Q9H6A9 2034 aa23.67■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 ZANQ9Y493 2812 aa23.67■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 UQCRHLA0A096LP55 91 aa23.66■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 UPK1AO00322 258 aa23.66■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 DLX3O60479 287 aa23.66■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 THBDP07204 575 aa23.66■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 NR1H2P55055 460 aa23.66■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 BTKQ06187 659 aa23.66■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa23.66■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 TMEM44Q2T9K0 475 aa23.66■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 LGSNQ5TDP6 509 aa23.66■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 SH2D5Q6ZV89 423 aa23.66■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 GGNQ86UU5 652 aa23.66■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 PRRG4Q9BZD6 226 aa23.66■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa23.66■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 FANCFQ9NPI8 374 aa23.66■■□□□ 1.38
PBRM1-218ENST00000458294 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms