RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449489.5

RBM39-218, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 5

Gene RBM39, Length 432 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-218ENST00000449489 TAB1Q15750 504 aa6.5□□□□□ -1.37
RBM39-218ENST00000449489 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RBM39-218ENST00000449489 CR1LQ2VPA4 569 aa6.5□□□□□ -1.37
RBM39-218ENST00000449489 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RBM39-218ENST00000449489 PAGE2BQ5JRK9 111 aa6.5□□□□□ -1.37
RBM39-218ENST00000449489 CDKL4Q5MAI5 379 aa6.5□□□□□ -1.37
RBM39-218ENST00000449489 DEPDC1Q5TB30 811 aa6.5□□□□□ -1.37
RBM39-218ENST00000449489 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa6.5□□□□□ -1.37
RBM39-218ENST00000449489 CNTN4Q8IWV2 1026 aa6.5□□□□□ -1.37
RBM39-218ENST00000449489 SYCE1Q8N0S2 351 aa6.5□□□□□ -1.37
RBM39-218ENST00000449489 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RBM39-218ENST00000449489 ZNF525Q8N782 197 aa6.5□□□□□ -1.37
RBM39-218ENST00000449489 KBTBD8Q8NFY9 601 aa6.5□□□□□ -1.37
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RBM39-218ENST00000449489 FAM216AQ8WUB2 273 aa6.5□□□□□ -1.37
RBM39-218ENST00000449489 C1orf54Q8WWF1 131 aa6.5□□□□□ -1.37
RBM39-218ENST00000449489 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RBM39-218ENST00000449489 UBE2E3Q969T4 207 aa6.5□□□□□ -1.37
RBM39-218ENST00000449489 S100PBPQ96BU1 408 aa6.5□□□□□ -1.37
RBM39-218ENST00000449489 TMCO6Q96DC7 493 aa6.5□□□□□ -1.37
RBM39-218ENST00000449489 OMA1Q96E52 524 aa6.5□□□□□ -1.37
RBM39-218ENST00000449489 LRRC1Q9BTT6 524 aa6.5□□□□□ -1.37
RBM39-218ENST00000449489 CACNG6Q9BXT2 260 aa6.5□□□□□ -1.37
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RBM39-218ENST00000449489 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
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RBM39-218ENST00000449489 FBXL2Q9UKC9 423 aa6.5□□□□□ -1.37
RBM39-218ENST00000449489 VWA7Q9Y334 891 aa6.5□□□□□ -1.37
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RBM39-218ENST00000449489 AP4B1Q9Y6B7 739 aa6.5□□□□□ -1.37
RBM39-218ENST00000449489 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa6.49□□□□□ -1.37
RBM39-218ENST00000449489 SHISA3A0PJX4 238 aa6.49□□□□□ -1.37
RBM39-218ENST00000449489 EFCAB8A8MWE9 144 aa6.49□□□□□ -1.37
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RBM39-218ENST00000449489 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RBM39-218ENST00000449489 AQP8O94778 261 aa6.49□□□□□ -1.37
RBM39-218ENST00000449489 ZNF205O95201 554 aa6.49□□□□□ -1.37
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RBM39-218ENST00000449489 TGFAP01135 160 aa6.49□□□□□ -1.37
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RBM39-218ENST00000449489 TTKP33981 857 aa6.49□□□□□ -1.37
RBM39-218ENST00000449489 GDF5P43026 501 aa6.49□□□□□ -1.37
RBM39-218ENST00000449489 MAGEA3P43357 314 aa6.49□□□□□ -1.37
RBM39-218ENST00000449489 NEK2P51955 445 aa6.49□□□□□ -1.37
RBM39-218ENST00000449489 GAS1P54826 345 aa6.49□□□□□ -1.37
RBM39-218ENST00000449489 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RBM39-218ENST00000449489 CTBP2P56545 445 aa6.49□□□□□ -1.37
RBM39-218ENST00000449489 BSPH1Q075Z2 132 aa6.49□□□□□ -1.37
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RBM39-218ENST00000449489 P2RY6Q15077 328 aa6.49□□□□□ -1.37
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RBM39-218ENST00000449489 B4DXG7 233 aa6.48□□□□□ -1.37
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RBM39-218ENST00000449489 GOLGA6L22H0YM25 854 aa6.48□□□□□ -1.37
RBM39-218ENST00000449489 PLGP00747 810 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
RBM39-218ENST00000449489 CT62P0C5K7 136 aa6.48□□□□□ -1.37
RBM39-218ENST00000449489 NR2F6P10588 404 aa6.48□□□□□ -1.37
RBM39-218ENST00000449489 APEHP13798 732 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
RBM39-218ENST00000449489 CD22P20273 847 aa6.48□□□□□ -1.37
RBM39-218ENST00000449489 GRK2P25098 689 aa6.48□□□□□ -1.37
RBM39-218ENST00000449489 CNTFP26441 200 aa6.48□□□□□ -1.37
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