RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439986.8

CCBE1-202, Transcript of collagen and calcium binding EGF domains 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCBE1, Length 6,227 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1-202ENST00000439986 GHRHRQ02643 423 aa11.01□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 RAET1LQ5VY80 246 aa11.01□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 TMEM41AQ96HV5 264 aa11.01□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 C16orf70Q9BSU1 422 aa11.01□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 OR8D2Q9GZM6 311 aa11.01□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 RGCCQ9H4X1 137 aa11.01□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 ADAM12O43184 909 aa11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 POP7O75817 140 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 GP1BBP13224 206 aa11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 ITGB8P26012 769 aa11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 PAX6P26367 422 aa11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 SOX2P48431 317 aa11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 HTR6P50406 440 aa11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 SLC6A19Q695T7 634 aa11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 SHKBP1Q8TBC3 707 aa11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 C1orf74Q96LT6 269 aa11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 TECTBQ96PL2 329 aa11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 DZANK1Q9NVP4 752 aa11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 ABCD2Q9UBJ2 740 aa11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 PKD1L3Q7Z443 1732 aa11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 HMX2A2RU54 273 aa11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 DISC1C4P0D8 188 aa11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 PPP6CO00743 305 aa11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 EOMESO95936 686 aa11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 KDELR2P33947 212 aa11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 SRYQ05066 204 aa11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 OTUB2Q96DC9 234 aa11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 SMIM12Q96EX1 92 aa11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 RAD9AQ99638 391 aa11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 OLAHQ9NV23 265 aa11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 SLC22A20A6NK97 555 aa11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 FGF4P08620 206 aa11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 TYRP14679 529 aa11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 DECR1Q16698 335 aa11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 HS3ST5Q8IZT8 346 aa11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 RAB8BQ92930 207 aa11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 CMTM7Q96FZ5 175 aa11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 TMEM246Q9BRR3 403 aa11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 PCTPQ9UKL6 214 aa11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 UBR2Q8IWV8 1755 aa11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 DCNP07585 359 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 SMIM18P0DKX4 95 aa11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 FASLGP48023 281 aa11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 ZNF542PQ5EBM4 170 aa11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 NPAS3Q8IXF0 933 aa11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 OCSTAMPQ9BR26 566 aa11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 SLC2A8Q9NY64 477 aa11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 HRH3Q9Y5N1 445 aa11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 CNIH1O95406 144 aa11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 HTR1AP08908 422 aa11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 CTSSP25774 331 aa11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 SLC6A4P31645 630 aa11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 SGCAQ16586 387 aa11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 CLEC14AQ86T13 490 aa11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 FJX1Q86VR8 437 aa11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 GKN2Q86XP6 184 aa11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 FAM217AQ8IXS0 508 aa11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 FRMD1Q8N878 549 aa11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 OR2AP1Q8NGE2 309 aa11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 NDNFQ8TB73 568 aa11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 NINJ1Q92982 152 aa11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa11□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 CCL5P13501 91 aa10.99□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 BMP8BP34820 402 aa10.99□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa10.99□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 OR6N2Q8NGY6 317 aa10.99□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 SLC22A17Q8WUG5 538 aa10.99□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 ACOT8O14734 319 aa10.99□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 PRSS56P0CW18 603 aa10.99□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 DCTP40126 519 aa10.99□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 FKBP1BP68106 108 aa10.99□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 THAP6Q8TBB0 222 aa10.99□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 ZFP90Q8TF47 636 aa10.99□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 SLC6A7Q99884 636 aa10.99□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 C17orf62Q9BQA9 187 aa10.99□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 BCL7BQ9BQE9 202 aa10.99□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 CPNE5Q9HCH3 593 aa10.99□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 CA14Q9ULX7 337 aa10.99□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 CMAHPQ9Y471 501 aa10.99□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 FEZF1A0PJY2 475 aa10.99□□□□□ -0.65
CCBE1-202ENST00000439986 GLTPD2A6NH11 291 aa10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 224.3 ms