RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436404.6

CNGA3-205, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 2,504 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-205ENST00000436404 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 C2orf42Q9NWW7 574 aa15.8■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 EXTL2Q9UBQ6 330 aa15.8■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 NUMA1Q14980 2115 aa15.8■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 A0A1W2PP55 124 aa15.79■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 NCR1O76036 304 aa15.79■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 HRGP04196 525 aa15.79■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 C4BPBP20851 252 aa15.79■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 CRATP43155 626 aa15.79■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 GAS6Q14393 721 aa15.79■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 CHRNA6Q15825 494 aa15.79■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 TMEM52BQ4KMG9 183 aa15.79■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa15.79■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 Q6ZVL8 140 aa15.79■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa15.79■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 VPS37AQ8NEZ2 397 aa15.79■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 FBRSQ9HAH7 460 aa15.79■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 CD93Q9NPY3 652 aa15.79■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 RHCGQ9UBD6 479 aa15.79■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa15.79■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa15.79■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 GABRR3A8MPY1 467 aa15.79■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 AGAP14A8MT82 685 aa15.79■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 SOX14O95416 240 aa15.79■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 TCRBP04435 133 aa15.79■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 GAAP10253 952 aa15.79■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 ELK1P19419 428 aa15.79■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 ITGALP20701 1170 aa15.79■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 AHCYP23526 432 aa15.79■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 AP1S2P56377 157 aa15.79■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 GPR85P60893 370 aa15.79■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 CACNG1Q06432 222 aa15.79■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 GAB1Q13480 694 aa15.79■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 GPR68Q15743 365 aa15.79■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 EOGTQ5NDL2 527 aa15.79■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 OR2G6Q5TZ20 316 aa15.79■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa15.79■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 PM20D2Q8IYS1 436 aa15.79■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 OR4N4Q8N0Y3 316 aa15.79■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 HUS1BQ8NHY5 278 aa15.79■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 NPAS1Q99742 590 aa15.79■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 H2AFJQ9BTM1 129 aa15.79■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 FOXQ1Q9C009 403 aa15.79■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 ELFN1P0C7U0 828 aa15.78■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 LCN1P31025 176 aa15.78■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 XKP51811 444 aa15.78■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 C21orf58P58505 322 aa15.78■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 SCRN3Q0VDG4 424 aa15.78■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 NFATC2Q13469 925 aa15.78■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 SCARB2Q14108 478 aa15.78■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 OPCMLQ14982 345 aa15.78■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 FTMTQ8N4E7 242 aa15.78■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 HDDC3Q8N4P3 179 aa15.78■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 FAM26EQ8N5C1 309 aa15.78■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 CLRN3Q8NCR9 226 aa15.78■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 GATAD2BQ8WXI9 593 aa15.78■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 SCAMP4Q969E2 229 aa15.78■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 RAB7BQ96AH8 199 aa15.78■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 MRGPRX1Q96LB2 322 aa15.78■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 SLC38A2Q96QD8 506 aa15.78■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 LMAN1LQ9HAT1 526 aa15.78■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 BRD7Q9NPI1 651 aa15.78■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 HPF1Q9NWY4 346 aa15.78■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 ZSCAN32Q9NX65 697 aa15.78■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 POMT2Q9UKY4 750 aa15.78■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 TMEM129A0AVI4 362 aa15.78■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 SERTM1A2A2V5 107 aa15.78■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 FAM227AF5H4B4 570 aa15.78■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 H3BN98 237 aa15.78■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 GMDSO60547 372 aa15.78■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 IFNA14P01570 189 aa15.78■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 HMGN1P05114 100 aa15.78■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 FCER2P06734 321 aa15.78■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 SYPP08247 313 aa15.78■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 ANXA5P08758 320 aa15.78■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 MAOBP27338 520 aa15.78■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 EPHA4P54764 986 aa15.78■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 PTPN5P54829 565 aa15.78■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 UNC5DQ6UXZ4 953 aa15.78■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 C3P1Q6ZMU1 363 aa15.78■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 CDC26Q8NHZ8 85 aa15.78■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa15.78■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 FBXL21Q9UKT6 434 aa15.78■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 TRPM6Q9BX84 2022 aa15.78■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 MUC3AQ02505 3323 aa15.78■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 TFPIP10646 304 aa15.77■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 PEPDP12955 493 aa15.77■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 ETFAP13804 333 aa15.77■□□□□ 0.12
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms