RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421832.2

CTU1-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTU1, Length 2,087 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1-201ENST00000421832 RBCK1Q9BYM8 510 aa22.83■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 NUAK2Q9H093 628 aa22.83■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 EXD2Q9NVH0 621 aa22.83■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 SERTAD3Q9UJW9 196 aa22.83■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 TIAF1O95411 115 aa22.82■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 IGFBP5P24593 272 aa22.82■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 FRKP42685 505 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 CDADC1Q9BWV3 514 aa22.82■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 APMAPQ9HDC9 416 aa22.82■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 HMX3A6NHT5 357 aa22.81■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 ALAS2P22557 587 aa22.81■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 YIF1BQ5BJH7 314 aa22.81■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 ANKRD34AQ69YU3 496 aa22.81■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa22.81■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 OR4N5Q8IXE1 308 aa22.81■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 TMCO6Q96DC7 493 aa22.81■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 PHOX2BQ99453 314 aa22.81■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 DHRS9Q9BPW9 319 aa22.81■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 CFAP54Q96N23 3096 aa22.81■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 ICMTO60725 284 aa22.81■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 FAM20BO75063 409 aa22.81■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 FEN1P39748 380 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 GPR50Q13585 617 aa22.81■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 PSD4Q8NDX1 1056 aa22.81■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 NDOR1Q9UHB4 597 aa22.81■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 CLCA2Q9UQC9 943 aa22.81■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 RNF6Q9Y252 685 aa22.81■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 OR1D4P47884 311 aa22.8■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 RAB38P57729 211 aa22.8■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 ACY1Q03154 408 aa22.8■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 HSPB3Q12988 150 aa22.8■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 FAM214AQ32MH5 1076 aa22.8■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 STPG1Q5TH74 334 aa22.8■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 GALNT6Q8NCL4 622 aa22.8■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 SUN3Q8TAQ9 357 aa22.8■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 PEX11GQ96HA9 241 aa22.8■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa22.8■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 GLIPR2Q9H4G4 154 aa22.8■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 TOR4AQ9NXH8 423 aa22.8■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 MS4A12Q9NXJ0 267 aa22.8■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 STMN3Q9NZ72 180 aa22.8■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 PRELID1Q9Y255 219 aa22.8■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 ELOVL7A1L3X0 281 aa22.8■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 CXCR6O00574 342 aa22.8■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 DSCR3O14972 297 aa22.8■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 LDB3O75112 727 aa22.8■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 UGT2B17O75795 530 aa22.8■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 YES1P07947 543 aa22.8■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 RPS5P46782 204 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 UGT2B15P54855 530 aa22.8■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 MANFP55145 182 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 ID2Q02363 134 aa22.8■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 DNAJB8Q8NHS0 232 aa22.8■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 FAM162AQ96A26 154 aa22.8■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 ZNF681Q96N22 645 aa22.8■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 AMDHD1Q96NU7 426 aa22.8■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 NDC1Q9BTX1 674 aa22.8■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 CXorf36Q9H7Y0 433 aa22.8■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 ADPRHL2Q9NX46 363 aa22.8■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 TAS2R9Q9NYW1 312 aa22.8■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 ACSL6Q9UKU0 697 aa22.8■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 GMPPBQ9Y5P6 360 aa22.8■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa22.8■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 ITGA2P17301 1181 aa22.79■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 PRKACGP22612 351 aa22.79■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 ERV3-1Q14264 604 aa22.79■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 CCDC116Q8IYX3 515 aa22.79■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 OR5AK3PQ8NH89 298 aa22.79■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 GON7Q9BXV9 100 aa22.79■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 OR2W5A6NFC9 320 aa22.78■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 MYO1GB0I1T2 1018 aa22.78■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 CCRL2O00421 344 aa22.78■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 IFNA8P32881 189 aa22.78■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP22.78■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 AVPR1BP47901 424 aa22.78■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 SPANXN2Q5MJ10 180 aa22.78■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 CCNJQ5T5M9 372 aa22.78■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 C1orf189Q5VU69 101 aa22.78■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 PIP4P1Q86T03 277 aa22.78■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 CCDC190Q86UF4 302 aa22.78■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 SLC38A9Q8NBW4 561 aa22.78■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 BBS4Q96RK4 519 aa22.78■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa22.78■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 EFCAB7A8K855 629 aa22.78■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 FGF17O60258 216 aa22.78■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
CTU1-201ENST00000421832 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms