RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SDHAF3Q9NRP4 125 aa11.84□□□□□ -0.51
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FLRT3Q9NZU0 649 aa11.84□□□□□ -0.51
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PAX1P15863 534 aa11.83□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TBXA2RP21731 343 aa11.83□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP11.83□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HSD17B3P37058 310 aa11.83□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SERPINB9P50453 376 aa11.83□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OCRLQ01968 901 aa11.83□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACSM2AQ08AH3 577 aa11.83□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RASA2Q15283 850 aa11.83□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SH2D4BQ5SQS7 431 aa11.83□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACSM2BQ68CK6 577 aa11.83□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM214BQ7L5A3 538 aa11.83□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM151AQ8N4L1 468 aa11.83□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C16orf78Q8WTQ4 265 aa11.83□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM171Q8WVE6 324 aa11.83□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa11.83□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 APIPQ96GX9 242 aa11.83□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EBPLQ9BY08 206 aa11.83□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa11.83□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RTN4RQ9BZR6 473 aa11.83□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADAM21Q9UKJ8 722 aa11.83□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NFU1Q9UMS0 254 aa11.83□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCNX3Q9H6A9 2034 aa11.83□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AQP8O94778 261 aa11.83□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SUPT7LO94864 414 aa11.83□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 THBDP07204 575 aa11.83□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPP3CBP16298 524 aa11.83□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HMOX2P30519 316 aa11.83□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MPIP34949 423 aa11.83□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HTR6P50406 440 aa11.83□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC7A5Q01650 507 aa11.83□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa11.83□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CYP27C1Q4G0S4 372 aa11.83□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa11.83□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR6K3Q8NGY3 331 aa11.83□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPATA3Q8NHX4 192 aa11.83□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZDHHC16Q969W1 377 aa11.83□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BBS4Q96RK4 519 aa11.83□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF382Q96SR6 550 aa11.83□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CXorf56Q9H5V9 222 aa11.83□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AP4B1Q9Y6B7 739 aa11.83□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CUBNO60494 3623 aa11.82□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ROS1P08922 2347 aa11.82□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A087WV62 115 aa11.82□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UQCRHLA0A096LP55 91 aa11.82□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRIM49D1C9J1S8 452 aa11.82□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLF4O43474 513 aa11.82□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMCC2O75069 709 aa11.82□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ULK1O75385 1050 aa11.82□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLITRK5O94991 958 aa11.82□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DDCP20711 480 aa11.82□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GSTM5P46439 218 aa11.82□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP11.82□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SGCBQ16585 318 aa11.82□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DECR1Q16698 335 aa11.82□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UNC50Q53HI1 259 aa11.82□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF678Q5SXM1 525 aa11.82□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPP4R4Q6NUP7 873 aa11.82□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C8orf74Q6P047 294 aa11.82□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GALNT18Q6P9A2 607 aa11.82□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM107Q6UX40 140 aa11.82□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GGNQ86UU5 652 aa11.82□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RELL1Q8IUW5 271 aa11.82□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 METTL6Q8TCB7 284 aa11.82□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM237Q96Q45 408 aa11.82□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 Q9N2J8 555 aa11.82□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EMC9Q9Y3B6 208 aa11.82□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MYO1GB0I1T2 1018 aa11.81□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SHISA8B8ZZ34 492 aa11.81□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PSMG1O95456 288 aa11.81□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IL33O95760 270 aa11.81□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 JUNP05412 331 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CASQ1P31415 396 aa11.81□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLK3P49761 638 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NR1H2P55055 460 aa11.81□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF763Q0D2J5 394 aa11.81□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TEX35Q5T0J7 233 aa11.81□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LGSNQ5TDP6 509 aa11.81□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STAC2Q6ZMT1 411 aa11.81□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SH2D5Q6ZV89 423 aa11.81□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MARCH3Q86UD3 253 aa11.81□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIF18AQ8NI77 898 aa11.81□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DUSP19Q8WTR2 217 aa11.81□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DCAKDQ8WVC6 231 aa11.81□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRRG4Q9BZD6 226 aa11.81□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa11.81□□□□□ -0.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms