RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa3.38□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa3.38□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A1W2PRU2 124 aa3.38□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CENPXA8MT69 81 aa3.38□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa3.38□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 IDH3BO43837 385 aa3.38□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 PDE9AO76083 593 aa3.38□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 HSMCR30P0CW71 290 aa3.38□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 NPR2P20594 1047 aa3.38□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 RORCP51449 518 aa3.38□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ZFP69Q49AA0 526 aa3.38□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM52BQ4KMG9 183 aa3.38□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 LINC01590Q5TEZ4 76 aa3.38□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM92BQ6ZTR7 304 aa3.38□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM109AQ8N4B1 249 aa3.38□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ZFP41Q8N8Y5 198 aa3.38□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 OR4A15Q8NGL6 344 aa3.38□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM203Q969S6 136 aa3.38□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 AP2M1Q96CW1 435 aa3.38□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 WDR13Q9H1Z4 485 aa3.38□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 PELI2Q9HAT8 420 aa3.38□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 C12orf10Q9HB07 376 aa3.38□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 KIF17Q9P2E2 1029 aa3.38□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 GPR52Q9Y2T5 361 aa3.38□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 TFECO14948 347 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 NDUFA2O43678 99 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CLEC3AO75596 197 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 MYCP01106 439 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 NGFRP08138 427 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 S1PR1P21453 382 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 GABRR2P28476 465 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 WEE1P30291 646 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CALCRP30988 508 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 PTH2RP49190 550 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM214AQ32MH5 1076 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 GARNL3Q5VVW2 1013 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 GPAT4Q86UL3 456 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ANKRA2Q9H9E1 313 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SPHK2Q9NRA0 654 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ENOPH1Q9UHY7 261 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 DUSP12Q9UNI6 340 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF292O60281 2723 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 MEIKINA0A087WXM9 373 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 WIPF3A6NGB9 483 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 GOLGA8CPA6NN73 597 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 HIDE1A8MVS5 230 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ISM1B1AKI9 464 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 TNNI3P19429 210 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 FCARP24071 287 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 XKP51811 444 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 LRRC32Q14392 662 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 KLHL22Q53GT1 634 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC27A4Q6P1M0 643 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 LRRTM4Q86VH4 590 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 OR5K2Q8NHB8 316 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 B3GNT4Q9C0J1 378 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 OR2AG1Q9H205 316 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 PIGUQ9H490 435 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 KLHL31Q9H511 634 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SERGEFQ9UGK8 458 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SNX8Q9Y5X2 465 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 A8MXK9 166 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 HOXA2O43364 376 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 GMNNO75496 209 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ACP5P13686 325 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CFL1P23528 166 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 BCL6P41182 706 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ARHGDIAP52565 204 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 PER3P56645 1201 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF750Q32MQ0 723 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC48A1Q6P1K1 146 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 PTCHD4Q6ZW05 846 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 Q8N402 240 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 LSMEM1Q8N8F7 131 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 EXD3Q8N9H8 876 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SMIM4Q8WVI0 70 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 TM4SF19Q96DZ7 209 aa3.37□□□□□ -1.87
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