RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 FBP2O00757 339 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 RBMXP38159 391 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 HBA1P69905 142 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 RPE65Q16518 533 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC5A12Q1EHB4 618 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 DCST2Q5T1A1 773 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 POTEKPQ9BYX7 375 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 PNMTP11086 282 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 ALG10Q5BKT4 473 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 PRR22Q8IZ63 422 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 OR7A17O14581 309 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 FUT1P19526 365 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 IMPA1P29218 277 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 CHRFAM7AQ494W8 412 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 FCRLBQ6BAA4 426 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 C2orf42Q9NWW7 574 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 FBXL3Q9UKT7 428 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 CIB4A0PJX0 185 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 UGT2B10P36537 528 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF100Q8IYN0 542 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 GPR137CQ8N3F9 429 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 METTL4Q8N3J2 472 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 BCL7BQ9BQE9 202 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 WASF3Q9UPY6 502 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 RAD51DO75771 328 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 CTBP2P56545 445 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 TMPPEQ6ZT21 453 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 POGLUT1Q8NBL1 392 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 SFXN5Q8TD22 340 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 NEDD4LQ96PU5 975 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 CA5BQ9Y2D0 317 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 H0YIV9 168 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 GABBR2O75899 941 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 VNN2O95498 520 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 TACR1P25103 407 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 AHRP35869 848 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC6A8P48029 635 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 MAN2A2P49641 1150 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 EMP2P54851 167 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 BTBD16Q32M84 506 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 RETREG3Q86VR2 466 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 BORCS8Q96FH0 119 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 PRSS16Q9NQE7 514 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 ANXA3P12429 323 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 HOXC5Q00444 222 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 SELPLGQ14242 412 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 LRRC26Q2I0M4 334 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 PLAG1Q6DJT9 500 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF43P17038 809 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 NLGN4XQ8N0W4 816 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 OR52R1Q8NGF1 315 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 A8MVJ9 347 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 MAOBP27338 520 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 CXCL12P48061 93 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 PPP5CP53041 499 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 UEVLDQ8IX04 471 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 SUN5Q8TC36 379 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 ALG8Q9BVK2 526 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC5A7Q9GZV3 580 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 HPF1Q9NWY4 346 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 CD6P30203 668 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 PYHIN1Q6K0P9 492 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 UGT2A3Q6UWM9 527 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 FNDC8Q8TC99 324 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 CHFRQ96EP1 664 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 OR4K3Q96R72 315 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 CD3GP09693 182 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 CD38P28907 300 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 ART1P52961 327 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 TLE3Q04726 772 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 CHRDL2Q6WN34 429 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 GATA6Q92908 595 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 ABCG2Q9UNQ0 655 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 SRPK3Q9UPE1 567 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 A0A1B0GUL6 1792 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 A6NCN8 305 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM171A2A8MVW0 826 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 M0R129 80 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
PTPRJ-201ENST00000418331 NINJ1Q92982 152 aa20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms