RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412161.1

SYNE1-AS1-201, SYNE1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SYNE1-AS1, Length 553 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CHST11Q9NPF2 352 aa7.83□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PNPOQ9NVS9 261 aa7.83□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZIM2Q9NZV7 527 aa7.83□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 STOML1Q9UBI4 398 aa7.83□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GIMAP2Q9UG22 337 aa7.83□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BTNL2Q9UIR0 455 aa7.83□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TINAGQ9UJW2 476 aa7.83□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NCKAP5O14513 1909 aa7.82□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 A0A1W2PQD3 144 aa7.82□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 AHRRA9YTQ3 701 aa7.82□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ALG1L2C9J202 215 aa7.82□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ANKRD28O15084 1053 aa7.82□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CFLARO15519 480 aa7.82□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FADS1O60427 444 aa7.82□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZG16O60844 167 aa7.82□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CYP4B1P13584 511 aa7.82□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HPGDP15428 266 aa7.82□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ATP6V1C1P21283 382 aa7.82□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 UQCRC2P22695 453 aa7.82□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CHMP24386 653 aa7.82□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EPHA3P29320 983 aa7.82□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 S100A3P33764 101 aa7.82□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GABRA3P34903 492 aa7.82□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PTGDSP41222 190 aa7.82□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 STX1BP61266 288 aa7.82□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C17orf67Q0P5P2 114 aa7.82□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GAB1Q13480 694 aa7.82□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PGS1Q32NB8 556 aa7.82□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa7.82□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FGD2Q7Z6J4 655 aa7.82□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MRGPRGQ86SM5 289 aa7.82□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa7.82□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OR4K17Q8NGC6 315 aa7.82□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM110BQ8TC76 370 aa7.82□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ADAMTS15Q8TE58 950 aa7.82□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC9A6Q92581 669 aa7.82□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 JADE3Q92613 823 aa7.82□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MAGEB18Q96M61 343 aa7.82□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZFP3Q96NJ6 502 aa7.82□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CCDC115Q96NT0 180 aa7.82□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CCDC28BQ9BUN5 200 aa7.82□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PRDM14Q9GZV8 571 aa7.82□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ANKRA2Q9H9E1 313 aa7.82□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC24A3Q9HC58 644 aa7.82□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MED4Q9NPJ6 270 aa7.82□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EQTNQ9NQ60 294 aa7.82□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 POLE3Q9NRF9 147 aa7.82□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 UBQLN4Q9NRR5 601 aa7.82□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EXD2Q9NVH0 621 aa7.82□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa7.82□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PRDM4Q9UKN5 801 aa7.82□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ACAD8Q9UKU7 415 aa7.82□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SNX8Q9Y5X2 465 aa7.82□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 USH1CQ9Y6N9 552 aa7.82□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ITPR2Q14571 2701 aa7.81□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PKDREJQ9NTG1 2253 aa7.81□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 A0A087WZY1 265 aa7.81□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa7.81□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa7.81□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NPIPA2E9PIF3 369 aa7.81□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NPIPA3F8WFD2 350 aa7.81□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 H3BNH8 94 aa7.81□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SCDO00767 359 aa7.81□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GNB5O14775 395 aa7.81□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 UBDO15205 165 aa7.81□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ATP8B1O43520 1251 aa7.81□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRAPPC6AO75865 159 aa7.81□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KCNK2O95069 426 aa7.81□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 UTS2O95399 124 aa7.81□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CLDN14O95500 239 aa7.81□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C6orf47O95873 294 aa7.81□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PGRP06401 933 aa7.81□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RFPL3SP0C7P2 107 aa7.81□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ACP2P11117 423 aa7.81□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF17P17021 662 aa7.81□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TBXA2RP21731 343 aa7.81□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CHRNB4P30926 498 aa7.81□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SOAT1P35610 550 aa7.81□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PEX19P40855 299 aa7.81□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PRKAG1P54619 331 aa7.81□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GAS1P54826 345 aa7.81□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HBA1P69905 142 aa7.81□□□□□ -1.16
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HSF1Q00613 529 aa7.81□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms