RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 ENOPH1Q9UHY7 261 aa3.71□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 PLCL2Q9UPR0 1127 aa3.71□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 CHST2Q9Y4C5 530 aa3.71□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 RNF215Q9Y6U7 377 aa3.71□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 SPEGQ15772 3267 aa3.71□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A087WUU8 490 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A087WV62 115 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A1W2PRQ8 180 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 GXYLT2A0PJZ3 443 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 ARRDC5A6NEK1 342 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 TLCD2A6NGC4 264 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 ZAR1LA6NP61 321 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 A8MU76 341 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 AGRPO00253 132 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 AP3D1O14617 1153 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 STX11O75558 287 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 CYP7B1O75881 506 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 NTN1O95631 604 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC35E2P0CK97 266 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 ITIH1P19827 911 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 PTNP21246 168 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 MMP11P24347 488 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 IFNA8P32881 189 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 ARL4DP49703 201 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 ST13P50502 369 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 SKP1P63208 163 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 OCA2Q04671 838 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 MGAT2Q10469 447 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 TUBA3CQ13748 450 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 MAPK14Q16539 360 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 DCST2Q5T1A1 773 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 FHL5Q5TD97 284 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 C11orf74Q86VG3 221 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 VWA5B2Q8N398 1253 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC25A45Q8N413 288 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF614Q8N883 585 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 OR52R1Q8NGF1 315 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC38A4Q969I6 547 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 MUL1Q969V5 352 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 RNF31Q96EP0 1072 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 ZDHHC12Q96GR4 267 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 PSD2Q9BQI7 771 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 UCK1Q9HA47 277 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 SEMA4GQ9NTN9 838 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 REV1Q9UBZ9 1251 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 FTSJ1Q9UET6 329 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 NDOR1Q9UHB4 597 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 MUTYHQ9UIF7 546 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 IFT52Q9Y366 437 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 MAU2Q9Y6X3 613 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 DSPPQ9NZW4 1301 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 UNC13CQ8NB66 2214 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 HRKO00198 91 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 SYT5O00445 386 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 PEX12O00623 359 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 CLDN4O14493 209 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 CBX7O95931 251 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 IFNA16P05015 189 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 LCKP06239 509 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 STSP08842 583 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 GKN3PP0CG01 181 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 CCNA2P20248 432 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 MAOAP21397 527 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 PRKAR1BP31321 381 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 SSTR4P31391 388 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 MASP1P48740 699 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 FNTBP49356 437 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 PGDP52209 483 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 GP2P55259 537 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 CSNK2BP67870 215 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 MVKQ03426 396 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 ST3GAL3Q11203 375 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 ILKQ13418 452 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM53BQ14153 422 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 TRAM2Q15035 370 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 ENTPD8Q5MY95 495 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 CASP12Q6UXS9 341 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF730Q6ZMV8 503 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 TTLL10Q6ZVT0 673 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 PRSS48Q7RTY5 328 aa3.7□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.5 ms