RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 CCNYL3P0C7X3 344 aa18.62■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 PPICP45877 212 aa18.62■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 GANABQ14697 944 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 FLYWCH1Q4VC44 716 aa18.62■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 TMEM164Q5U3C3 297 aa18.62■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 ZNF836Q6ZNA1 936 aa18.62■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa18.62■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 ART5Q96L15 291 aa18.62■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa18.62■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 PINK1Q9BXM7 581 aa18.62■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 THSD1Q9NS62 852 aa18.62■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 FLRT3Q9NZU0 649 aa18.62■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa18.62■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 MASP2O00187 686 aa18.61■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 FFAR1O14842 300 aa18.61■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 PEX1O43933 1283 aa18.61■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 LGI1O95970 557 aa18.61■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 AK1P00568 194 aa18.61■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 IFNW1P05000 195 aa18.61■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 CEACAM1P13688 526 aa18.61■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 IL7RP16871 459 aa18.61■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 PRKACGP22612 351 aa18.61■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 RRM2P31350 389 aa18.61■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 HOXC5Q00444 222 aa18.61■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 DEF8Q6ZN54 512 aa18.61■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 PEX5LQ8IYB4 626 aa18.61■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 OR6T1Q8NGN1 323 aa18.61■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 RASSF5Q8WWW0 418 aa18.61■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 LPAR4Q99677 370 aa18.61■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 SEMA4CQ9C0C4 833 aa18.61■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 SPTBN2O15020 2390 aa18.61■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 EI24O14681 340 aa18.61■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 F8A1P23610 371 aa18.61■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 DCTP40126 519 aa18.61■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 RNF4P78317 190 aa18.61■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 PLAURQ03405 335 aa18.61■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 KCNC4Q03721 635 aa18.61■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 NPTX1Q15818 432 aa18.61■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 TCTN3Q6NUS6 607 aa18.61■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 C7orf57Q8NEG2 295 aa18.61■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 OR52J3Q8NH60 311 aa18.61■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 TPST2O60704 377 aa18.6■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 E2F6O75461 281 aa18.6■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 CELA2AP08217 269 aa18.6■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 DRD5P21918 477 aa18.6■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 FOLR3P41439 243 aa18.6■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 GABREP78334 506 aa18.6■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 PCOLCEQ15113 449 aa18.6■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 PDZK1Q5T2W1 519 aa18.6■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 SLC29A4Q7RTT9 530 aa18.6■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 ZNF614Q8N883 585 aa18.6■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 OR4C3Q8NH37 302 aa18.6■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 DNAJC9Q8WXX5 260 aa18.6■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 CTPS2Q9NRF8 586 aa18.6■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 TCFL5Q9UL49 500 aa18.6■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 CFL2Q9Y281 166 aa18.6■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 ENPP4Q9Y6X5 453 aa18.6■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 PCSK5Q92824 1860 aa18.6■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 ZFHX4Q86UP3 3567 aa18.59■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa18.59■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa18.59■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 C7orf72A4D263 438 aa18.59■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 FRG2CA6NGY1 282 aa18.59■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 G3V2T6 193 aa18.59■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 ATP6V1C1P21283 382 aa18.59■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 PRKAR1BP31321 381 aa18.59■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 SLC26A5P58743 744 aa18.59■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 KIRREL2Q6UWL6 708 aa18.59■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 STK32CQ86UX6 486 aa18.59■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 TMPRSS12Q86WS5 348 aa18.59■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 ZNF441Q8N8Z8 693 aa18.59■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 VCX3BQ9H321 246 aa18.59■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 DLL3Q9NYJ7 618 aa18.59■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 NTNG1Q9Y2I2 539 aa18.59■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 C15orf41Q9Y2V0 281 aa18.59■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa18.59■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 PPP4R4Q6NUP7 873 aa18.59■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa18.59■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 HSDL2Q6YN16 418 aa18.59■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 C9orf16Q9BUW7 83 aa18.59■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 SMURF2Q9HAU4 748 aa18.59■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 LRRC42Q9Y546 428 aa18.59■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 AKAP13Q12802 2813 aa18.58■□□□□ 0.57
ODC1-202ENST00000405333 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa18.58■□□□□ 0.56
ODC1-202ENST00000405333 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa18.58■□□□□ 0.56
ODC1-202ENST00000405333 TMEM200CA6NKL6 621 aa18.58■□□□□ 0.56
ODC1-202ENST00000405333 NPIPB9F8W1W9 429 aa18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50 ms