RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398073.6

CTDSP2-201, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 4,795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-201ENST00000398073 NANSQ9NR45 359 aa15.45■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 OR6C74A6NCV1 312 aa15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 PRAF2O60831 178 aa15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 RNH1P13489 461 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 GRK1Q15835 563 aa15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF440Q8IYI8 595 aa15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 CYB561A3Q8NBI2 242 aa15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC46A2Q9BY10 475 aa15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 PDFQ9HBH1 243 aa15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 PPT2Q9UMR5 302 aa15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 NAP1L6A6NFF2 107 aa15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 RNF13O43567 381 aa15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 SPARCP09486 303 aa15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 BMP1P13497 986 aa15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 CSF2RAP15509 400 aa15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 FNTBP49356 437 aa15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 TSPAN31Q12999 210 aa15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM26DQ5JW98 314 aa15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 METTL11BQ5VVY1 283 aa15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 HACD4Q5VWC8 232 aa15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 CSNK1A1LQ8N752 337 aa15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 CASTOR1Q8WTX7 329 aa15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 HCSTQ9UBK5 93 aa15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF726A6NNF4 738 aa15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 H7C2Y5 167 aa15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 PPP1R3DO95685 299 aa15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 PRKCAP17252 672 aa15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 RFLNAQ6ZTI6 216 aa15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF584Q8IVC4 421 aa15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 SIMC1Q8NDZ2 872 aa15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 OR5J2Q8NH18 312 aa15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 DOK4Q8TEW6 326 aa15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 FOXJ1Q92949 421 aa15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 ATG5Q9H1Y0 275 aa15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 TAS2R3Q9NYW6 316 aa15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 I6L893 689 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 AGTR1P30556 359 aa15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM198BQ6UWH4 519 aa15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 NLRP8Q86W28 1048 aa15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 SPNS2Q8IVW8 549 aa15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 NLGN4XQ8N0W4 816 aa15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 GATSQ8NAP1 163 aa15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 ORAI3Q9BRQ5 295 aa15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 SEC61A2Q9H9S3 476 aa15.44■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 OR7A10O76100 309 aa15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 KCTD9Q7L273 389 aa15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 VRK3Q8IV63 474 aa15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 OR4N4Q8N0Y3 316 aa15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 OR2T4Q8NH00 348 aa15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 SMARCD2Q92925 531 aa15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 RBP7Q96R05 134 aa15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 SDHAF3Q9NRP4 125 aa15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 INPP5EQ9NRR6 644 aa15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 PCDH10Q9P2E7 1040 aa15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 RASD1Q9Y272 281 aa15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 OR5K4A6NMS3 321 aa15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 SNTA1Q13424 505 aa15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 MAPK14Q16539 360 aa15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 ACSM3Q53FZ2 586 aa15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 RAD9AQ99638 391 aa15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 ADAM29Q9UKF5 820 aa15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 HEPACAM2A8MVW5 462 aa15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 NR2C1P13056 603 aa15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 C5AR1P21730 350 aa15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 PFN3P60673 137 aa15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 NNATQ16517 81 aa15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 COX20Q5RI15 118 aa15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 C12orf40Q86WS4 652 aa15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 STX12Q86Y82 276 aa15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 PLA2G15Q8NCC3 412 aa15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 COQ10AQ96MF6 247 aa15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 MRI1Q9BV20 369 aa15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 OR52D1Q9H346 318 aa15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 DHDHQ9UQ10 334 aa15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
CTDSP2-201ENST00000398073 ABCA11PQ4W5N1 156 aa15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms