RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394202.8

CNN3-202, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CNN3, Length 1,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-202ENST00000394202 PLAG1Q6DJT9 500 aa21.48■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 MRGPREQ86SM8 312 aa21.48■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 ZNF619Q8N2I2 560 aa21.48■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 P4HTMQ9NXG6 502 aa21.48■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 WASF3Q9UPY6 502 aa21.48■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 SH3GLB1Q9Y371 365 aa21.48■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 UGT2B17O75795 530 aa21.48■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 FESP07332 822 aa21.48■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 LIPCP11150 499 aa21.48■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 LIFP15018 202 aa21.48■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 DCAF7P61962 342 aa21.48■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 VLDLRP98155 873 aa21.48■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 HMBOX1Q6NT76 420 aa21.48■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 AMIGO2Q86SJ2 522 aa21.48■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 OR52P1PQ8NH57 321 aa21.48■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa21.48■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 C7orf34Q96L11 122 aa21.48■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 SCNM1Q9BWG6 230 aa21.48■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 RLIMQ9NVW2 624 aa21.48■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 FLRT3Q9NZU0 649 aa21.48■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 AGAP5A6NIR3 686 aa21.47■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 WWP2O00308 870 aa21.47■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 ALPPP05187 535 aa21.47■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 IQCCQ4KMZ1 466 aa21.47■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 FLYWCH1Q4VC44 716 aa21.47■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 ZNF311Q5JNZ3 666 aa21.47■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 PQLC1Q8N2U9 271 aa21.47■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 OR4C3Q8NH37 302 aa21.47■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 MAGIXQ9H6Y5 334 aa21.47■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 LAMA5O15230 3695 aa21.47■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 NINQ8N4C6 2090 aa21.47■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 hCG_2039718K7EN88 272 aa21.47■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 ABCD3P28288 659 aa21.47■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 DECR1Q16698 335 aa21.47■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 TCTN3Q6NUS6 607 aa21.47■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 CLIP4Q8N3C7 705 aa21.47■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 C17orf47Q8NEP4 570 aa21.47■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 OR4D11Q8NGI4 311 aa21.47■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 NUBPLQ8TB37 319 aa21.47■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 SPPL2AQ8TCT8 520 aa21.47■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 LZICQ8WZA0 190 aa21.47■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa21.47■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 IL1RAPQ9NPH3 570 aa21.47■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 RIMS3Q9UJD0 308 aa21.47■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 ABCG2Q9UNQ0 655 aa21.47■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 TO15178 435 aa21.46■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 ZFAND5O76080 213 aa21.46■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 DIRAS1O95057 198 aa21.46■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 ATP6V1C1P21283 382 aa21.46■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 ST13P50502 369 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 ATP1A4Q13733 1029 aa21.46■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 EXT1Q16394 746 aa21.46■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 LACC1Q8IV20 430 aa21.46■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 OR8K3Q8NH51 312 aa21.46■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 M1APQ8TC57 530 aa21.46■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 ADOQ96SZ5 270 aa21.46■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 DEFB126Q9BYW3 111 aa21.46■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 MMP25Q9NPA2 562 aa21.46■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa21.46■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 LOC400499M0QZD8 3231 aa21.45■■□□□ 1.03
CNN3-202ENST00000394202 IL33O95760 270 aa21.45■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 SLC34A1Q06495 639 aa21.45■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP21.45■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa21.45■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa21.45■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 PEX5LQ8IYB4 626 aa21.45■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 NRG4Q8WWG1 115 aa21.45■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 TP53INP1Q96A56 240 aa21.45■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 NACC2Q96BF6 587 aa21.45■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 G6PC3Q9BUM1 346 aa21.45■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 EFHD1Q9BUP0 239 aa21.45■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa21.45■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 FAM117AQ9C073 453 aa21.45■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 POLE3Q9NRF9 147 aa21.45■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 MYOTQ9UBF9 498 aa21.45■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 NPIPB9F8W1W9 429 aa21.45■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 MAN1A2O60476 641 aa21.45■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 REM1O75628 298 aa21.45■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 ITGAMP11215 1152 aa21.45■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 IL7RP16871 459 aa21.45■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 MAGEA2P43356 314 aa21.45■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 IFI44LQ53G44 452 aa21.45■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 PDZK1Q5T2W1 519 aa21.45■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa21.45■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 ERMP1Q7Z2K6 904 aa21.45■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 DIO2Q92813 273 aa21.45■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 OMA1Q96E52 524 aa21.45■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 HSPBAP1Q96EW2 488 aa21.45■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa21.45■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 BAG5Q9UL15 447 aa21.45■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms