RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392449.4

PTPRK-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 1,456 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-208ENST00000392449 CD99P14209 185 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRK-208ENST00000392449 GABRA3P34903 492 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRK-208ENST00000392449 CCT5P48643 541 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRK-208ENST00000392449 CLDN20P56880 219 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRK-208ENST00000392449 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
PTPRK-208ENST00000392449 LIPMQ5VYY2 423 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRK-208ENST00000392449 Q6ZSR9 355 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRK-208ENST00000392449 IKBIPQ70UQ0 350 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRK-208ENST00000392449 P4HA3Q7Z4N8 544 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRK-208ENST00000392449 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRK-208ENST00000392449 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRK-208ENST00000392449 OR2W6PQ8NHA6 318 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRK-208ENST00000392449 FAM76AQ8TAV0 307 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRK-208ENST00000392449 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
PTPRK-208ENST00000392449 ZFP3Q96NJ6 502 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRK-208ENST00000392449 TSSK3Q96PN8 268 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRK-208ENST00000392449 YIPF4Q9BSR8 244 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRK-208ENST00000392449 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
PTPRK-208ENST00000392449 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
PTPRK-208ENST00000392449 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRK-208ENST00000392449 LRTM1Q9HBL6 345 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRK-208ENST00000392449 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRK-208ENST00000392449 SH3D21A4FU49 640 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRK-208ENST00000392449 SLC22A20A6NK97 555 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRK-208ENST00000392449 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP14.96□□□□□ -0.01
PTPRK-208ENST00000392449 UTS2O95399 124 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRK-208ENST00000392449 IL33O95760 270 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRK-208ENST00000392449 HRGP04196 525 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRK-208ENST00000392449 LINC00032P0C843 101 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRK-208ENST00000392449 SDC1P18827 310 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRK-208ENST00000392449 KLK2P20151 261 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRK-208ENST00000392449 PRKAG1P54619 331 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRK-208ENST00000392449 SIRPAP78324 504 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRK-208ENST00000392449 PSPHP78330 225 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRK-208ENST00000392449 GRAMD1BQ3KR37 738 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRK-208ENST00000392449 TDRPQ86YL5 185 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRK-208ENST00000392449 SMPDL3BQ92485 455 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRK-208ENST00000392449 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
PTPRK-208ENST00000392449 C1orf109Q9NX04 203 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRK-208ENST00000392449 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
PTPRK-208ENST00000392449 GIMAP2Q9UG22 337 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRK-208ENST00000392449 PACSIN3Q9UKS6 424 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRK-208ENST00000392449 ABCG2Q9UNQ0 655 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRK-208ENST00000392449 OR2M5A3KFT3 312 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-208ENST00000392449 A8MXE2 369 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-208ENST00000392449 AZIN1O14977 448 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-208ENST00000392449 PDPK1O15530 556 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-208ENST00000392449 SLITRK5O94991 958 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-208ENST00000392449 ATE1O95260 518 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-208ENST00000392449 CHRNGP07510 517 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-208ENST00000392449 GPC1P35052 558 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-208ENST00000392449 RPL38P63173 70 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-208ENST00000392449 FAM27E3Q08E93 113 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-208ENST00000392449 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-208ENST00000392449 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-208ENST00000392449 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-208ENST00000392449 SZRD1Q7Z422 152 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-208ENST00000392449 BTLAQ7Z6A9 289 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-208ENST00000392449 ZAR1Q86SH2 424 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-208ENST00000392449 STARD4Q96DR4 205 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-208ENST00000392449 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-208ENST00000392449 NPAS1Q99742 590 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-208ENST00000392449 MECRQ9BV79 373 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-208ENST00000392449 PINK1Q9BXM7 581 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-208ENST00000392449 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-208ENST00000392449 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-208ENST00000392449 TLDC2A0PJX2 215 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-208ENST00000392449 H3BQF6 201 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-208ENST00000392449 SLC28A1O00337 649 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-208ENST00000392449 RGS14O43566 566 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-208ENST00000392449 ANGPTL1O95841 491 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-208ENST00000392449 RAF1P04049 648 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-208ENST00000392449 PEPDP12955 493 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-208ENST00000392449 PRPH2P23942 346 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-208ENST00000392449 SLC18A2Q05940 514 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-208ENST00000392449 BCL2A1Q16548 175 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-208ENST00000392449 GALNTL6Q49A17 601 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-208ENST00000392449 CHMP1BQ7LBR1 199 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-208ENST00000392449 GATSQ8NAP1 163 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-208ENST00000392449 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-208ENST00000392449 FNDC9Q8TBE3 224 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-208ENST00000392449 GPR151Q8TDV0 419 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-208ENST00000392449 SLC9A6Q92581 669 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-208ENST00000392449 FCRL1Q96LA6 429 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-208ENST00000392449 DACH2Q96NX9 599 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-208ENST00000392449 KLHDC3Q9BQ90 382 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-208ENST00000392449 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-208ENST00000392449 ACBD3Q9H3P7 528 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-208ENST00000392449 PIGMQ9H3S5 423 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-208ENST00000392449 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-208ENST00000392449 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRK-208ENST00000392449 NPIPB8E9PQR5 432 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRK-208ENST00000392449 LSM1O15116 133 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
PTPRK-208ENST00000392449 SIAH2O43255 324 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRK-208ENST00000392449 ACP2P11117 423 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRK-208ENST00000392449 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
PTPRK-208ENST00000392449 DIO3P55073 304 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRK-208ENST00000392449 NAA20P61599 178 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRK-208ENST00000392449 ADAM8P78325 824 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRK-208ENST00000392449 KEAP1Q14145 624 aa14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.9 ms