RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF367Q7RTV3 350 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 TMPRSS11BQ86T26 416 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 ACOT1Q86TX2 421 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 ZSWIM9Q86XI8 627 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 GPD1LQ8N335 351 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 TEX45Q8NA69 505 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 OR4C5Q8NGB2 326 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 CD99L2Q8TCZ2 262 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 CDKL2Q92772 493 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 TCEAL4Q96EI5 215 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 C11orf70Q9BRQ4 267 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 SLC26A1Q9H2B4 701 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 BEX1Q9HBH7 125 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 SPAG4Q9NPE6 437 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 SERTAD4Q9NUC0 356 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 POT1Q9NUX5 634 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 ABCG2Q9UNQ0 655 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 ROBO3Q96MS0 1386 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 SH3TC1Q8TE82 1336 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 WASHC1A8K0Z3 465 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 TCP11X1B4DZS4 312 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 FAM90A26D6RGX4 464 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 CLIC1O00299 241 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 COPEO14579 308 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 ARPC3O15145 178 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 STX7O15400 261 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 HSPA12AO43301 675 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 TRIAP1O43715 76 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 MAGEC1O60732 1142 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 DCNP07585 359 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 NR1D1P20393 614 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 HRH2P25021 359 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 HSD17B3P37058 310 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 MAGEA12P43365 314 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 CHRNA4P43681 627 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 NSFP46459 744 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 ARHGDIAP52565 204 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 SP3Q02447 781 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 ART3Q13508 389 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 CDKN3Q16667 212 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 UGT3A2Q3SY77 523 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 ZCWPW2Q504Y3 356 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 CARD17Q5XLA6 110 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 PRR5LQ6MZQ0 368 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 WASH2PQ6VEQ5 465 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF852Q6ZMS4 543 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 D2HGDHQ8N465 521 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF565Q8N9K5 539 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 CNBD1Q8NA66 436 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 OR56A1Q8NGH5 318 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF461Q8TAF7 563 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 SDR42E1Q8WUS8 393 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 SELENOMQ8WWX9 145 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 ACOT12Q8WYK0 555 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 PIK3R3Q92569 461 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 BDH2Q9BUT1 245 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 SPACA1Q9HBV2 294 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 HMG20AQ9NP66 347 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 BATF3Q9NR55 127 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 ASNSD1Q9NWL6 643 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 GLS2Q9UI32 602 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 PITPNC1Q9UKF7 332 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 PSMD13Q9UNM6 376 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 SEC16AO15027 2179 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 A0A1W2PPV9 198 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 SH3PXD2BA1X283 911 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 HSBP1L1C9JCN9 74 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 M0QYV0 167 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 AIPO00170 330 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 PRRG1O14668 218 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 SLC16A5O15375 505 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 PRKAB2O43741 272 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 SRP72O76094 671 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 APOA2P02652 100 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 SMIM6P0DI80 62 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 RALBP11234 206 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 PPP3CBP16298 524 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 CCNOP22674 350 aa2.3□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms