RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 TECRLQ5HYJ1 363 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 RGS9BPQ6ZS82 235 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 SH2D5Q6ZV89 423 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 AAED1Q7RTV5 226 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF550Q7Z398 422 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 DNAJC22Q8N4W6 341 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 ATG16L2Q8NAA4 619 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 LINC01555Q8NAE3 123 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 POGLUT1Q8NBL1 392 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 OR5P2Q8WZ92 322 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 SEC16BQ96JE7 1060 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 ITPAQ9BY32 194 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 UBQLN4Q9NRR5 601 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 CNIH4Q9P003 139 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 EMCNQ9ULC0 261 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 AP4B1Q9Y6B7 739 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 HECTD1Q9ULT8 2610 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 LRIT2A6NDA9 550 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 HSPB2A8KAH6 182 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 BCKDKO14874 412 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 FGF17O60258 216 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 BCL10O95999 233 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 ANKRD34CP0C6C1 535 aa4.11□□□□□ -1.75
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PTPRC-201ENST00000348564 GMFBP60983 142 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 DMTNQ08495 405 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 HSPB2Q16082 182 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 OR2A2Q6IF42 318 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 C6orf120Q7Z4R8 191 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 CLEC4FQ8N1N0 589 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 NEK7Q8TDX7 302 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 PIK3R3Q92569 461 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 ISL2Q96A47 359 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 MS4A6EQ96DS6 147 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 PIK3IP1Q96FE7 263 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 UBXN10Q96LJ8 280 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 NSMCE2Q96MF7 247 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 S100A13Q99584 98 aa4.11□□□□□ -1.75
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PTPRC-201ENST00000348564 CHODLQ9H9P2 273 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 OXSMQ9NWU1 459 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 IMPAD1Q9NX62 359 aa4.11□□□□□ -1.75
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PTPRC-201ENST00000348564 GIMAP2Q9UG22 337 aa4.11□□□□□ -1.75
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PTPRC-201ENST00000348564 ZNF407Q9C0G0 2248 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 PRORSD1PA6NEY8 169 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 GPR171O14626 319 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 ITM2AO43736 263 aa4.11□□□□□ -1.75
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PTPRC-201ENST00000348564 F8A1P23610 371 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 PSMA3P25788 255 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 OPRM1P35372 400 aa4.11□□□□□ -1.75
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PTPRC-201ENST00000348564 KLHL12Q53G59 568 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 CDCP2Q5VXM1 449 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM154Q6P9G4 183 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 KLHL17Q6TDP4 642 aa4.11□□□□□ -1.75
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PTPRC-201ENST00000348564 SPPL2CQ8IUH8 684 aa4.11□□□□□ -1.75
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PTPRC-201ENST00000348564 OR9K2Q8NGE7 335 aa4.11□□□□□ -1.75
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PTPRC-201ENST00000348564 GIMAP7Q8NHV1 300 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 RHEBL1Q8TAI7 183 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
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PTPRC-201ENST00000348564 FAIMQ9NVQ4 179 aa4.11□□□□□ -1.75
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PTPRC-201ENST00000348564 G3V2L1 256 aa4.11□□□□□ -1.75
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PTPRC-201ENST00000348564 CBR3O75828 277 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 INMTO95050 263 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 CRYAAP02489 173 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 PCSK2P16519 638 aa4.11□□□□□ -1.75
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PTPRC-201ENST00000348564 RUNX2Q13950 521 aa4.11□□□□□ -1.75
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PTPRC-201ENST00000348564 CEBPEQ15744 281 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 DPY19L1Q2PZI1 675 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 GXYLT1Q4G148 440 aa4.11□□□□□ -1.75
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