RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 FAM180AQ6UWF9 173 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 GRHL3Q8TE85 626 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 RCN3Q96D15 328 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 SDF2Q99470 211 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 CGREF1Q99674 301 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 RAD21L1Q9H4I0 556 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 PROK2Q9HC23 129 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 GALNT9Q9HCQ5 603 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 ANKRD33BA6NCL7 494 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 EVPLLA8MZ36 301 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 EVI2BP34910 448 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 RGNQ15493 299 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 GRAMD1BQ3KR37 738 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 FRMD6Q96NE9 622 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 ANKRD27Q96NW4 1050 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 OSBPL11Q9BXB4 747 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 ANGPTL4Q9BY76 406 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 NTNG1Q9Y2I2 539 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 C2orf72A6NCS6 295 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 MAGEA8P43361 318 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 DSTNP60981 165 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 PLGLB1Q02325 96 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 GPAT3Q53EU6 434 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 RUNDC3AQ59EK9 446 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 SLC30A6Q6NXT4 461 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 OLIG3Q7RTU3 272 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 PACS2Q86VP3 889 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 ROPN1LQ96C74 230 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 CMTM5Q96DZ9 223 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 SLC39A3Q9BRY0 314 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 TRIM8Q9BZR9 551 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 IKZF5Q9H5V7 419 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 PCNX3Q9H6A9 2034 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 SHANK1Q9Y566 2161 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXD4-201ENST00000306324 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXD4-201ENST00000306324 NPIPA7E9PJI5 369 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXD4-201ENST00000306324 AIM2O14862 343 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXD4-201ENST00000306324 SCO2O43819 266 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXD4-201ENST00000306324 STX11O75558 287 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXD4-201ENST00000306324 SNX4O95219 450 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXD4-201ENST00000306324 NPIPA8P0DM63 369 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXD4-201ENST00000306324 MASP1P48740 699 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXD4-201ENST00000306324 HPCAP84074 193 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXD4-201ENST00000306324 FUT5Q11128 374 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXD4-201ENST00000306324 FADDQ13158 208 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXD4-201ENST00000306324 SNTA1Q13424 505 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXD4-201ENST00000306324 FLYWCH1Q4VC44 716 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM81Q6P7N7 255 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXD4-201ENST00000306324 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
HOXD4-201ENST00000306324 OR4C3Q8NH37 302 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXD4-201ENST00000306324 CPT1CQ8TCG5 803 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXD4-201ENST00000306324 LRRC58Q96CX6 371 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXD4-201ENST00000306324 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
HOXD4-201ENST00000306324 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXD4-201ENST00000306324 ASF1BQ9NVP2 202 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXD4-201ENST00000306324 GID8Q9NWU2 228 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXD4-201ENST00000306324 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
HOXD4-201ENST00000306324 CORO2BQ9UQ03 480 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXD4-201ENST00000306324 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
HOXD4-201ENST00000306324 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXD4-201ENST00000306324 FADS1O60427 444 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXD4-201ENST00000306324 FCMRO60667 390 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXD4-201ENST00000306324 CRYABP02511 175 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
HOXD4-201ENST00000306324 NR2F1P10589 423 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXD4-201ENST00000306324 HPGDP15428 266 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF24P17028 368 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXD4-201ENST00000306324 LCN1P31025 176 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXD4-201ENST00000306324 PTGDSP41222 190 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXD4-201ENST00000306324 CLK3P49761 638 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
HOXD4-201ENST00000306324 MTPNP58546 118 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXD4-201ENST00000306324 GPR68Q15743 365 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXD4-201ENST00000306324 SYPL1Q16563 259 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXD4-201ENST00000306324 ANKFN1Q8N957 763 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXD4-201ENST00000306324 POGLUT1Q8NBL1 392 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF597Q96LX8 424 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXD4-201ENST00000306324 TTTY12Q9BZ98 90 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXD4-201ENST00000306324 UBQLN4Q9NRR5 601 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXD4-201ENST00000306324 P2RX2Q9UBL9 471 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXD4-201ENST00000306324 MKLN1Q9UL63 735 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXD4-201ENST00000306324 ABCG2Q9UNQ0 655 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXD4-201ENST00000306324 LIPT1Q9Y234 373 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXD4-201ENST00000306324 GNB5O14775 395 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXD4-201ENST00000306324 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
HOXD4-201ENST00000306324 NPPAP01160 153 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXD4-201ENST00000306324 NUDT7P0C024 238 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXD4-201ENST00000306324 DCTP40126 519 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXD4-201ENST00000306324 FOXO1Q12778 655 aa20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms