RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	AMFR	Q9UKV5	643 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SNAP23-223	ENST00000627440	CIB4	A0PJX0	185 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	KRT87P	A6NCN2	255 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	NUPR2	A6NF83	97 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	NDST3	O95803	873 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	GSN	P06396	782 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	CHRM4	P08173	479 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	COX5A	P20674	150 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	IGHV1-2	P23083	117 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	ASIP	P42127	132 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	KIR2DS4	P43632	304 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	FMO5	P49326	533 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	HSD17B7	P56937	341 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	PAX8	Q06710	450 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	PRDX1	Q06830	199 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	TCEAL1	Q15170	157 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC30A6	Q6NXT4	461 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM65	Q6PI78	240 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	NUDT13	Q86X67	352 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	CLDN19	Q8N6F1	224 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF721	Q8TF20	911 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC13A3	Q8WWT9	602 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	CLIC6	Q96NY7	704 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	DDX47	Q9H0S4	455 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	PPA2	Q9H2U2	334 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	EXOC1	Q9NV70	894 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	KLRF1	Q9NZS2	232 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	SPATA7	Q9P0W8	599 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	IL20RA	Q9UHF4	553 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	LRP2	P98164	4655 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	KCNE1B	A0A087WTH5	132 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	MYOCOS	A0A1B0GUC4	107 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	LY86	O95711	162 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	TCN1	P20061	433 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	NPR2	P20594	1047 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	ITGAL	P20701	1170 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	CD80	P33681	288 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	SERPINB6	P35237	376 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	BDKRB1	P46663	353 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	POU3F4	P49335	361 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	KLK7	P49862	253 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	CDH17	Q12864	832 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	EFR3A	Q14156	821 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	NEPRO	Q6NW34	567 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	PLBD1	Q6P4A8	553 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	PLCZ1	Q86YW0	608 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC22A15	Q8IZD6	547 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	WDSUB1	Q8N9V3	476 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	OR52B6	Q8NGF0	335 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	SMPDL3A	Q92484	453 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	ZDHHC3	Q9NYG2	299 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	OR5V1	Q9UGF6	321 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	FBXL2	Q9UKC9	423 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF337	Q9Y3M9	751 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	IGLV3-16	A0A075B6K0	115 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A0G2JLM5	398 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	ISPD	A4D126	451 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	CXorf65	A6NEN9	183 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	BECN2	A8MW95	431 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	CLDN25	C9JDP6	229 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440		H7BY64	318 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	CCER2	I3L3R5	266 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440		M0R233	179 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	EIF1AY	O14602	144 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	CEP104	O60308	925 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	ZIC3	O60481	467 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	DNAJA2	O60884	412 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	ICOSLG	O75144	302 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	AP2A2	O94973	939 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	ETHE1	O95571	254 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	IL33	O95760	270 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	ACP2	P11117	423 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	RYK	P34925	604 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	ERVFRD-1	P60508	538 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	GNB2	P62879	340 aa		5.19	□□□□□ -1.58

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