RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 HRASLS5Q96KN8 279 aa20.07■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF285Q96NJ3 590 aa20.07■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 KCNC2Q96PR1 638 aa20.07■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 DUSP21Q9H596 190 aa20.07■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 ENPP4Q9Y6X5 453 aa20.07■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 SEC16AO15027 2179 aa20.07■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 FITM1A5D6W6 292 aa20.07■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 HAT1O14929 419 aa20.07■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 DSCR3O14972 297 aa20.07■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 PDE9AO76083 593 aa20.07■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 TFPTP0C1Z6 253 aa20.07■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 FAM87AP0C7U9 286 aa20.07■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 LIMS1P48059 325 aa20.07■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 KCNC4Q03721 635 aa20.07■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 RELAQ04206 551 aa20.07■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa20.07■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 ABHD17CQ6PCB6 329 aa20.07■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa20.07■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 FAM198BQ6UWH4 519 aa20.07■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF605Q86T29 641 aa20.07■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 CSNK1A1LQ8N752 337 aa20.07■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 AMER3Q8N944 861 aa20.07■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 OR2L5Q8NG80 312 aa20.07■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 OR2A5Q96R48 311 aa20.07■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 NODALQ96S42 347 aa20.07■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 PIP5K1AQ99755 562 aa20.07■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 SH3GL3Q99963 347 aa20.07■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa20.07■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 PRDM7Q9NQW5 492 aa20.07■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 TPRKBQ9Y3C4 175 aa20.07■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 SNX5Q9Y5X3 404 aa20.07■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 ARRDC5A6NEK1 342 aa20.06■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 H3BMQ9 156 aa20.06■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 RHCEP18577 417 aa20.06■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 PLA2G16P53816 162 aa20.06■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 CSNK2BP67870 215 aa20.06■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 MICAQ29983 383 aa20.06■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 FAM69BQ5VUD6 431 aa20.06■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 GPR107Q5VW38 600 aa20.06■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 TMEM64Q6YI46 380 aa20.06■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 SLC38A5Q8WUX1 472 aa20.06■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 MUL1Q969V5 352 aa20.06■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 COG8Q96MW5 612 aa20.06■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 EXD2Q9NVH0 621 aa20.06■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 TESMINQ9Y4I5 508 aa20.06■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 ASB4Q9Y574 426 aa20.06■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 B4GALT2O60909 372 aa20.05■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 SERPIND1P05546 499 aa20.05■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 CCT3P49368 545 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 SPDYE7PQ495Y7 208 aa20.05■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 CNIH3Q8TBE1 160 aa20.05■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 THAP4Q8WY91 577 aa20.05■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 COL26A1Q96A83 441 aa20.05■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 AMDHD1Q96NU7 426 aa20.05■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 KLHL31Q9H511 634 aa20.05■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 POFUT2Q9Y2G5 429 aa20.05■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 C5orf58C9J3I9 102 aa20.04■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 SFTPCP11686 197 aa20.04■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 CYP4B1P13584 511 aa20.04■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 CD247P20963 164 aa20.04■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 PCMT1P22061 227 aa20.04■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 OR1D4P47884 311 aa20.04■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 RPP38P78345 283 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 SLC35A2P78381 396 aa20.04■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 IL1RL1Q01638 556 aa20.04■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 SPIBQ01892 262 aa20.04■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 HSPB3Q12988 150 aa20.04■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 EXD3Q8N9H8 876 aa20.04■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa20.04■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 OR10G2Q8NGC3 310 aa20.04■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 SFXN5Q8TD22 340 aa20.04■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 SGCDQ92629 289 aa20.04■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 FEVQ99581 238 aa20.04■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 LHPPQ9H008 270 aa20.04■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa20.04■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 SCN3BQ9NY72 215 aa20.04■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 MAU2Q9Y6X3 613 aa20.04■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 HMGN4O00479 90 aa20.03■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 ERI3O43414 337 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 NOL3O60936 208 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 MFN2O95140 757 aa20.03■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 IFNW1P05000 195 aa20.03■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 TNFRSF1BP20333 461 aa20.03■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 GCGRP47871 477 aa20.03■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 OR1E2P47887 323 aa20.03■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 IL10RAQ13651 578 aa20.03■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 FAM180BQ6P0A1 224 aa20.03■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 ACOT4Q8N9L9 421 aa20.03■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 RASSF5Q8WWW0 418 aa20.03■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 TMEM19Q96HH6 336 aa20.03■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 GLIPR2Q9H4G4 154 aa20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms