RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618056.4

PMS1-220, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-220ENST00000618056 NKX2-2O95096 273 aa22.73■■□□□ 1.23
PMS1-220ENST00000618056 LBPP18428 481 aa22.73■■□□□ 1.23
PMS1-220ENST00000618056 PRR5P85299 388 aa22.73■■□□□ 1.23
PMS1-220ENST00000618056 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa22.73■■□□□ 1.23
PMS1-220ENST00000618056 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
PMS1-220ENST00000618056 SH3GL2Q99962 352 aa22.73■■□□□ 1.23
PMS1-220ENST00000618056 DUSP26Q9BV47 211 aa22.73■■□□□ 1.23
PMS1-220ENST00000618056 PNPLA3Q9NST1 481 aa22.73■■□□□ 1.23
PMS1-220ENST00000618056 SPRR3Q9UBC9 169 aa22.73■■□□□ 1.23
PMS1-220ENST00000618056 WIF1Q9Y5W5 379 aa22.73■■□□□ 1.23
PMS1-220ENST00000618056 HDAC3O15379 428 aa22.72■■□□□ 1.23
PMS1-220ENST00000618056 IL33O95760 270 aa22.72■■□□□ 1.23
PMS1-220ENST00000618056 CYP4B1P13584 511 aa22.72■■□□□ 1.23
PMS1-220ENST00000618056 PRKAG1P54619 331 aa22.72■■□□□ 1.23
PMS1-220ENST00000618056 ART3Q13508 389 aa22.72■■□□□ 1.23
PMS1-220ENST00000618056 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
PMS1-220ENST00000618056 WDSUB1Q8N9V3 476 aa22.72■■□□□ 1.23
PMS1-220ENST00000618056 NUDT8Q8WV74 236 aa22.72■■□□□ 1.23
PMS1-220ENST00000618056 NEUROD4Q9HD90 331 aa22.72■■□□□ 1.23
PMS1-220ENST00000618056 ACAD8Q9UKU7 415 aa22.72■■□□□ 1.23
PMS1-220ENST00000618056 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa22.72■■□□□ 1.23
PMS1-220ENST00000618056 PKDREJQ9NTG1 2253 aa22.71■■□□□ 1.23
PMS1-220ENST00000618056 TRPC5OSA6NMA1 111 aa22.71■■□□□ 1.23
PMS1-220ENST00000618056 SLCO1B7G3V0H7 640 aa22.71■■□□□ 1.23
PMS1-220ENST00000618056 SDHDO14521 159 aa22.71■■□□□ 1.23
PMS1-220ENST00000618056 TRAPPC6AO75865 159 aa22.71■■□□□ 1.23
PMS1-220ENST00000618056 GABRA3P34903 492 aa22.71■■□□□ 1.23
PMS1-220ENST00000618056 GAS1P54826 345 aa22.71■■□□□ 1.23
PMS1-220ENST00000618056 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
PMS1-220ENST00000618056 TTMPQ5BVD1 217 aa22.71■■□□□ 1.23
PMS1-220ENST00000618056 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
PMS1-220ENST00000618056 TMEM211Q6ICI0 200 aa22.71■■□□□ 1.23
PMS1-220ENST00000618056 MFSD12Q6NUT3 480 aa22.71■■□□□ 1.23
PMS1-220ENST00000618056 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa22.71■■□□□ 1.23
PMS1-220ENST00000618056 ABCG2Q9UNQ0 655 aa22.71■■□□□ 1.23
PMS1-220ENST00000618056 C2orf72A6NCS6 295 aa22.7■■□□□ 1.22
PMS1-220ENST00000618056 FIGNL2A6NMB9 653 aa22.7■■□□□ 1.22
PMS1-220ENST00000618056 FADS1O60427 444 aa22.7■■□□□ 1.22
PMS1-220ENST00000618056 CBR3O75828 277 aa22.7■■□□□ 1.22
PMS1-220ENST00000618056 EVI2BP34910 448 aa22.7■■□□□ 1.22
PMS1-220ENST00000618056 TRPC1P48995 793 aa22.7■■□□□ 1.22
PMS1-220ENST00000618056 WLSQ5T9L3 541 aa22.7■■□□□ 1.22
PMS1-220ENST00000618056 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
PMS1-220ENST00000618056 SZRD1Q7Z422 152 aa22.7■■□□□ 1.22
PMS1-220ENST00000618056 MARVELD2Q8N4S9 558 aa22.7■■□□□ 1.22
PMS1-220ENST00000618056 OR5M9Q8NGP3 310 aa22.7■■□□□ 1.22
PMS1-220ENST00000618056 GPR151Q8TDV0 419 aa22.7■■□□□ 1.22
PMS1-220ENST00000618056 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
PMS1-220ENST00000618056 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
PMS1-220ENST00000618056 CACNA1DQ01668 2161 aa22.7■■□□□ 1.22
PMS1-220ENST00000618056 ITPR2Q14571 2701 aa22.69■■□□□ 1.22
PMS1-220ENST00000618056 ANKRD28O15084 1053 aa22.69■■□□□ 1.22
PMS1-220ENST00000618056 WDR1O75083 606 aa22.69■■□□□ 1.22
PMS1-220ENST00000618056 KCNH1O95259 989 aa22.69■■□□□ 1.22
PMS1-220ENST00000618056 C6orf47O95873 294 aa22.69■■□□□ 1.22
PMS1-220ENST00000618056 ACP2P11117 423 aa22.69■■□□□ 1.22
PMS1-220ENST00000618056 ACVR2AP27037 513 aa22.69■■□□□ 1.22
PMS1-220ENST00000618056 PLCZ1Q86YW0 608 aa22.69■■□□□ 1.22
PMS1-220ENST00000618056 SLC16A11Q8NCK7 471 aa22.69■■□□□ 1.22
PMS1-220ENST00000618056 OR8J2Q8NGG1 315 aa22.69■■□□□ 1.22
PMS1-220ENST00000618056 PIK3R3Q92569 461 aa22.69■■□□□ 1.22
PMS1-220ENST00000618056 SLC9A6Q92581 669 aa22.69■■□□□ 1.22
PMS1-220ENST00000618056 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
PMS1-220ENST00000618056 DPY30Q9C005 99 aa22.69■■□□□ 1.22
PMS1-220ENST00000618056 CXorf36Q9H7Y0 433 aa22.69■■□□□ 1.22
PMS1-220ENST00000618056 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
PMS1-220ENST00000618056 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
PMS1-220ENST00000618056 GXYLT2A0PJZ3 443 aa22.68■■□□□ 1.22
PMS1-220ENST00000618056 CCT3P49368 545 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
PMS1-220ENST00000618056 PRIM2P49643 509 aa22.68■■□□□ 1.22
PMS1-220ENST00000618056 PGS1Q32NB8 556 aa22.68■■□□□ 1.22
PMS1-220ENST00000618056 NHSL2Q5HYW2 709 aa22.68■■□□□ 1.22
PMS1-220ENST00000618056 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa22.68■■□□□ 1.22
PMS1-220ENST00000618056 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
PMS1-220ENST00000618056 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
PMS1-220ENST00000618056 OR56A1Q8NGH5 318 aa22.68■■□□□ 1.22
PMS1-220ENST00000618056 SFXN5Q8TD22 340 aa22.68■■□□□ 1.22
PMS1-220ENST00000618056 TESCQ96BS2 214 aa22.68■■□□□ 1.22
PMS1-220ENST00000618056 MOAP1Q96BY2 351 aa22.68■■□□□ 1.22
PMS1-220ENST00000618056 DTNBP1Q96EV8 351 aa22.68■■□□□ 1.22
PMS1-220ENST00000618056 SERHLQ9NQF3 203 aa22.68■■□□□ 1.22
PMS1-220ENST00000618056 GIN1Q9NXP7 522 aa22.68■■□□□ 1.22
PMS1-220ENST00000618056 SNX8Q9Y5X2 465 aa22.68■■□□□ 1.22
PMS1-220ENST00000618056 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
PMS1-220ENST00000618056 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
PMS1-220ENST00000618056 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
PMS1-220ENST00000618056 TOMM20Q15388 145 aa22.67■■□□□ 1.22
PMS1-220ENST00000618056 DUSP5Q16690 384 aa22.67■■□□□ 1.22
PMS1-220ENST00000618056 DPY19L1Q2PZI1 675 aa22.67■■□□□ 1.22
PMS1-220ENST00000618056 ZNF585AQ6P3V2 769 aa22.67■■□□□ 1.22
PMS1-220ENST00000618056 SPATA19Q7Z5L4 167 aa22.67■■□□□ 1.22
PMS1-220ENST00000618056 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
PMS1-220ENST00000618056 FAM110BQ8TC76 370 aa22.67■■□□□ 1.22
PMS1-220ENST00000618056 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
PMS1-220ENST00000618056 C16orf58Q96GQ5 468 aa22.67■■□□□ 1.22
PMS1-220ENST00000618056 STACQ99469 402 aa22.67■■□□□ 1.22
PMS1-220ENST00000618056 OR2B2Q9GZK3 357 aa22.67■■□□□ 1.22
PMS1-220ENST00000618056 DUSP22Q9NRW4 184 aa22.67■■□□□ 1.22
PMS1-220ENST00000618056 NOTCH2Q04721 2471 aa22.67■■□□□ 1.22
PMS1-220ENST00000618056 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa22.66■■□□□ 1.22
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