RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	HSPB3	Q12988	150 aa		19.79	■□□□□ 0.76
PPP4C-205	ENST00000563200	CES4A	Q5XG92	561 aa		19.79	■□□□□ 0.76
PPP4C-205	ENST00000563200	CLHC1	Q8NHS4	586 aa		19.79	■□□□□ 0.76
PPP4C-205	ENST00000563200	AGR3	Q8TD06	166 aa		19.79	■□□□□ 0.76
PPP4C-205	ENST00000563200	PPCDC	Q96CD2	204 aa		19.79	■□□□□ 0.76
PPP4C-205	ENST00000563200	C3orf30	Q96M34	536 aa		19.79	■□□□□ 0.76
PPP4C-205	ENST00000563200	FLRT3	Q9NZU0	649 aa		19.79	■□□□□ 0.76
PPP4C-205	ENST00000563200	GIMAP2	Q9UG22	337 aa		19.79	■□□□□ 0.76
PPP4C-205	ENST00000563200	ZDHHC2	Q9UIJ5	367 aa		19.79	■□□□□ 0.76
PPP4C-205	ENST00000563200	CAMK2A	Q9UQM7	478 aa		19.79	■□□□□ 0.76
PPP4C-205	ENST00000563200	CD8B2	A6NJW9	211 aa		19.78	■□□□□ 0.76
PPP4C-205	ENST00000563200	HSPB2	A8KAH6	182 aa		19.78	■□□□□ 0.76
PPP4C-205	ENST00000563200	ASMT	P46597	345 aa		19.78	■□□□□ 0.76
PPP4C-205	ENST00000563200	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	19.78	■□□□□ 0.76	1e-11	■■■■■ 50.5
PPP4C-205	ENST00000563200	HSPB2	Q16082	182 aa		19.78	■□□□□ 0.76
PPP4C-205	ENST00000563200	OR5M10	Q6IEU7	315 aa		19.78	■□□□□ 0.76
PPP4C-205	ENST00000563200	MTERF3	Q96E29	417 aa		19.78	■□□□□ 0.76
PPP4C-205	ENST00000563200	PPP3R2	Q96LZ3	170 aa		19.78	■□□□□ 0.76
PPP4C-205	ENST00000563200		Q9N2J8	555 aa		19.78	■□□□□ 0.76
PPP4C-205	ENST00000563200	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	19.78	■□□□□ 0.76
PPP4C-205	ENST00000563200	TAS2R10	Q9NYW0	307 aa		19.78	■□□□□ 0.76
PPP4C-205	ENST00000563200	NUP214	P35658	2090 aa	Predicted RBP	19.78	■□□□□ 0.76
PPP4C-205	ENST00000563200	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		19.77	■□□□□ 0.76
PPP4C-205	ENST00000563200	TTC36	A6NLP5	189 aa		19.77	■□□□□ 0.76
PPP4C-205	ENST00000563200	ENO4	A6NNW6	628 aa		19.77	■□□□□ 0.76
PPP4C-205	ENST00000563200	ZIC3	O60481	467 aa		19.77	■□□□□ 0.76
PPP4C-205	ENST00000563200	IL33	O95760	270 aa		19.77	■□□□□ 0.76
PPP4C-205	ENST00000563200	PRPS2	P11908	318 aa		19.77	■□□□□ 0.76
PPP4C-205	ENST00000563200	DLX5	P56178	289 aa		19.77	■□□□□ 0.76
PPP4C-205	ENST00000563200	TLE4	Q04727	773 aa		19.77	■□□□□ 0.76
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	19.77	■□□□□ 0.76
PPP4C-205	ENST00000563200	DECR1	Q16698	335 aa		19.77	■□□□□ 0.76
PPP4C-205	ENST00000563200	KRT71	Q3SY84	523 aa		19.77	■□□□□ 0.76
PPP4C-205	ENST00000563200	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		19.77	■□□□□ 0.76
PPP4C-205	ENST00000563200	FADS6	Q8N9I5	356 aa		19.77	■□□□□ 0.76
PPP4C-205	ENST00000563200	RELL2	Q8NC24	303 aa	Predicted RBP	19.77	■□□□□ 0.76
PPP4C-205	ENST00000563200	OR14L1P	Q8NHC6	308 aa		19.77	■□□□□ 0.76
PPP4C-205	ENST00000563200	ZPLD1	Q8TCW7	415 aa		19.77	■□□□□ 0.76
PPP4C-205	ENST00000563200	GIMAP5	Q96F15	307 aa		19.77	■□□□□ 0.76
PPP4C-205	ENST00000563200	ZBED6CL	Q96FA7	236 aa	Predicted RBP	19.77	■□□□□ 0.76
PPP4C-205	ENST00000563200	RTN4R	Q9BZR6	473 aa		19.77	■□□□□ 0.76
PPP4C-205	ENST00000563200	MCCC2	Q9HCC0	563 aa		19.77	■□□□□ 0.76
PPP4C-205	ENST00000563200	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		19.77	■□□□□ 0.76
PPP4C-205	ENST00000563200	ABCG2	Q9UNQ0	655 aa		19.77	■□□□□ 0.76
PPP4C-205	ENST00000563200	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	19.76	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	19.76	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	19.76	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF136	P52737	540 aa		19.76	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		19.76	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		19.76	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	IFNE	Q86WN2	208 aa		19.76	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		19.76	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		19.76	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	19.76	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	CALHM2	Q9HA72	323 aa		19.76	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	19.76	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM120C	Q9NX05	1096 aa	Known RBP	19.76	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF629	Q9UEG4	869 aa	Predicted RBP	19.76	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	ATP6V1H	Q9UI12	483 aa		19.76	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	PEX11A	O75192	247 aa		19.76	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	NKX2-2	O95096	273 aa		19.76	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	GABRA3	P34903	492 aa		19.76	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	GCK	P35557	465 aa		19.76	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	SERPINB4	P48594	390 aa		19.76	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	MANF	P55145	182 aa	Known RBP	19.76	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	B3GALT5-AS1	P59052	145 aa		19.76	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	MLC1	Q15049	377 aa		19.76	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	C6orf136	Q5SQH8	315 aa		19.76	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		19.76	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	MED12L	Q86YW9	2145 aa		19.76	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	TRIB1	Q96RU8	372 aa		19.76	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	G6PC3	Q9BUM1	346 aa		19.76	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	19.75	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		19.75	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM114	B3SHH9	223 aa		19.75	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	SCAMP2	O15127	329 aa	Known RBP	19.75	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	RGS16	O15492	202 aa	Predicted RBP	19.75	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	19.75	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	IL2RA	P01589	272 aa		19.75	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	IGKV1D-16	P01601	117 aa		19.75	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	DPP4	P27487	766 aa		19.75	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	GPC1	P35052	558 aa		19.75	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	LHX2	P50458	406 aa		19.75	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	PTGR1	Q14914	329 aa		19.75	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	ATP6AP1L	Q52LC2	224 aa		19.75	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	19.75	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	ENPP6	Q6UWR7	440 aa		19.75	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	R3HCC1L	Q7Z5L2	792 aa	Known RBP	19.75	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	NUDCD3	Q8IVD9	361 aa		19.75	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	OR2M3	Q8NG83	312 aa		19.75	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		19.75	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	PIK3R3	Q92569	461 aa		19.75	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	PKNOX2	Q96KN3	472 aa		19.75	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	UCN2	Q96RP3	112 aa		19.75	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	TUBA1C	Q9BQE3	449 aa		19.75	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	C3orf14	Q9HBI5	128 aa		19.75	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	EQTN	Q9NQ60	294 aa		19.75	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	KCNN3	Q9UGI6	736 aa		19.75	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	MRTO4	Q9UKD2	239 aa	Known RBP	19.75	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		19.75	■□□□□ 0.75

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