RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561395.5

TPM1-231, Transcript of tropomyosin 1, human

TSL 5

Gene TPM1, Length 673 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPM1-231	ENST00000561395	RAB26	Q9ULW5	256 aa		7	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	CDC14A	Q9UNH5	594 aa		7	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	LIPT1	Q9Y234	373 aa		7	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	MMACHC	Q9Y4U1	282 aa		7	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		7	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	KCNE3	Q9Y6H6	103 aa		7	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	MAU2	Q9Y6X3	613 aa		7	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	DSPP	Q9NZW4	1301 aa		7	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	CCDC88C	Q9P219	2028 aa		7	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	RP1L1	Q8IWN7	2480 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395		A0A0G2JPF8	293 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	PRAMEF25	A6NGN4	478 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	DUXA	A6NLW8	204 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	HNRNPCL2	B2RXH8	293 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	HNRNPCL3	B7ZW38	293 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	DLGAP1	O14490	977 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	GNGT2	O14610	69 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	COQ9	O75208	318 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	NME6	O75414	186 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	JRK	O75564	520 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	H6PD	O95479	791 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	CBX7	O95931	251 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	HPR	P00739	348 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	HNRNPCL4	P0DMR1	293 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	ACP2	P11117	423 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	ETS2	P15036	469 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	TNFRSF1B	P20333	461 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	MAOA	P21397	527 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	S1PR1	P21453	382 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	ALAS2	P22557	587 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	GALNS	P34059	522 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	DCT	P40126	519 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	OR1D4	P47884	311 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	IST1	P53990	364 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	BTG2	P78543	158 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	DUSP8	Q13202	625 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	BIK	Q13323	160 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	DAG1	Q14118	895 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	SERTAD2	Q14140	314 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	EXOSC7	Q15024	291 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	TBR1	Q16650	682 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	DUSP5	Q16690	384 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	GPAT3	Q53EU6	434 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	TRMT12	Q53H54	448 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	ATAD3B	Q5T9A4	648 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	OR2T5	Q6IEZ7	315 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	SHQ1	Q6PI26	577 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	TBPL2	Q6SJ96	375 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	DGAT2L6	Q6ZPD8	337 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	QSOX2	Q6ZRP7	698 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	C16orf62	Q7Z3J2	963 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	WDR53	Q7Z5U6	358 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	TSEN54	Q7Z6J9	526 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	KRT73	Q86Y46	540 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	GALNT12	Q8IXK2	581 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	SMYD1	Q8NB12	490 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	GPR32P1	Q8NGA4	272 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	OR2T29	Q8NH02	315 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	SPPL2A	Q8TCT8	520 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	DOK4	Q8TEW6	326 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	APOBEC4	Q8WW27	367 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	RASSF5	Q8WWW0	418 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	SDCCAG3	Q96C92	435 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	SLC35A4	Q96G79	324 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	COL21A1	Q96P44	957 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	DGAT2	Q96PD7	388 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	EPYC	Q99645	322 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	PELO	Q9BRX2	385 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	OSBPL11	Q9BXB4	747 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	RSPO3	Q9BXY4	272 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	GABARAPL1	Q9H0R8	117 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	SLC38A1	Q9H2H9	487 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395		Q9H521	79 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	ZNF304	Q9HCX3	659 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	ADAP2	Q9NPF8	381 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	EXD2	Q9NVH0	621 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	USE1	Q9NZ43	259 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	CALML5	Q9NZT1	146 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	BAG5	Q9UL15	447 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	AP4B1	Q9Y6B7	739 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	POLQ	O75417	2590 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	ESPL1	Q14674	2120 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	IGKV3D-11	A0A0A0MRZ8	115 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TPM1-231	ENST00000561395	OR2W5	A6NFC9	320 aa		6.98	□□□□□ -1.29

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