RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559642.1

BMP4-208, Transcript of bone morphogenetic protein 4, human

TSL 3

Gene BMP4, Length 505 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BMP4-208	ENST00000559642	STX5	Q13190	355 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	DECR1	Q16698	335 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	ZNF630	Q2M218	657 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	C1orf185	Q5T7R7	199 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	CPTP	Q5TA50	214 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	TMEM211	Q6ICI0	200 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	B3GNT6	Q6ZMB0	384 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	CCDC71	Q8IV32	467 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	RIMKLA	Q8IXN7	391 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	GPR151	Q8TDV0	419 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	SLC9A6	Q92581	669 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	ARL8A	Q96BM9	186 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	FAM120B	Q96EK7	910 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	ZCCHC3	Q9NUD5	404 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	ASIC5	Q9NY37	505 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	NKIRAS1	Q9NYS0	192 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	COQ3	Q9NZJ6	369 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	MARCO	Q9UEW3	520 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	RNF6	Q9Y252	685 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	SNX8	Q9Y5X2	465 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	KIAA1549	Q9HCM3	1950 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	EMC8	O43402	210 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	WDR1	O75083	606 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	SNN	O75324	88 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	IL33	O95760	270 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	GLI4	P10075	376 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	BMP7	P18075	431 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	PRPS1L1	P21108	318 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	MAP3K8	P41279	467 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	WNT3	P56703	355 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	MRPS22	P82650	360 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	DUSP5	Q16690	384 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	PGS1	Q32NB8	556 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	PLCZ1	Q86YW0	608 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	ULK2	Q8IYT8	1036 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	OR14L1P	Q8NHC6	308 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	CA5BP1	Q8WTZ4	195 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	JADE3	Q92613	823 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	RND1	Q92730	232 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	TIMP4	Q99727	224 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	TTYH2	Q9BSA4	534 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	DUSP26	Q9BV47	211 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	UGT2B28	Q9BY64	529 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	RTN4R	Q9BZR6	473 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	OR2B2	Q9GZK3	357 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	MEAF6	Q9HAF1	191 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	C3orf14	Q9HBI5	128 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	NTM	Q9P121	344 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642		A0A0G2JNJ9	132 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	NKX2-6	A6NCS4	301 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	SDHD	O14521	159 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	FADS1	O60427	444 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	NKX2-2	O95096	273 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	KCNH1	O95259	989 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	UTS2	O95399	124 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	KIT	P10721	976 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	SOAT1	P35610	550 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	ADH7	P40394	386 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	SLC18A1	P54219	525 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	CLDN8	P56748	225 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	C21orf58	P58505	322 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	PRR5	P85299	388 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	TP53BP2	Q13625	1128 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	MLC1	Q15049	377 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	SMU1	Q2TAY7	513 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	AGBL2	Q5U5Z8	902 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	OR4F3	Q6IEY1	312 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	ACAD11	Q709F0	780 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	ZAR1	Q86SH2	424 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	CLECL1	Q8IZS7	167 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	OR10Q1	Q8NGQ4	319 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	OR5AK3P	Q8NH89	298 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	OR5P2	Q8WZ92	322 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	MED12	Q93074	2177 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	MARVELD3	Q96A59	401 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	COQ8B	Q96D53	544 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	CHMP6	Q96FZ7	201 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	UCK2	Q9BZX2	261 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	FAM120C	Q9NX05	1096 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
BMP4-208	ENST00000559642	TAS2R10	Q9NYW0	307 aa		11.73	□□□□□ -0.53

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