RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552985.5

TPCN1-223, Transcript of two pore segment channel 1, human

TSL 3

Gene TPCN1, Length 762 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPCN1-223	ENST00000552985	SUCO	Q9UBS9	1254 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	MAPRE3	Q9UPY8	281 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	SNX8	Q9Y5X2	465 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985		C9JVG2	144 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985		E9PLN8	166 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF195	O14628	629 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	FADS1	O60427	444 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	HCN1	O60741	890 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	ABCB7	O75027	752 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	TRAPPC6A	O75865	159 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	NKX2-2	O95096	273 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	IL33	O95760	270 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	RFX3	P48380	749 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	NME5	P56597	212 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	HBA1	P69905	142 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	PSPH	P78330	225 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	MRPS22	P82650	360 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	EFR3A	Q14156	821 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	CDSN	Q15517	529 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	DUSP5	Q16690	384 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	DECR1	Q16698	335 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	GXYLT1	Q4G148	440 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	EIPR1	Q53HC9	387 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	OR5M10	Q6IEU7	315 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	OGFOD2	Q6N063	350 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	ZAR1	Q86SH2	424 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	CLECL1	Q8IZS7	167 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	OR1J4	Q8NGS1	313 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	PSMA8	Q8TAA3	256 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	NEIL3	Q8TAT5	605 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	GPR151	Q8TDV0	419 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	SLC9A6	Q92581	669 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	TEX37	Q96LM6	180 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	DPY30	Q9C005	99 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985		Q9N2J8	555 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	SERHL	Q9NQF3	203 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	ZCCHC3	Q9NUD5	404 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	AIG1	Q9NVV5	245 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	B4GALT7	Q9UBV7	327 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	FBXL2	Q9UKC9	423 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	SLC6A5	Q9Y345	797 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	WIF1	Q9Y5W5	379 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	KIAA1549	Q9HCM3	1950 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	OR14I1	A6ND48	311 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	TTC36	A6NLP5	189 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	TRPC5OS	A6NMA1	111 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	CFLAR	O15519	480 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	SCO2	O43819	266 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	SCN2B	O60939	215 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	HMGN2	P05204	90 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	HPN	P05981	417 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	ELAVL4	P26378	380 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	IL12A	P29459	219 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	EVI2B	P34910	448 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	CCT3	P49368	545 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	UFM1	P61960	85 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	PRR5	P85299	388 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	TOMM20	Q15388	145 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	SPANXN4	Q5MJ08	99 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	MTFR2	Q6P444	385 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	APOOL	Q6UXV4	268 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	YRDC	Q86U90	279 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	ANKRD46	Q86W74	232 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	CLEC4F	Q8N1N0	589 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	FAM83F	Q8NEG4	500 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	OR5AK3P	Q8NH89	298 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	JADE3	Q92613	823 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	MARK4	Q96L34	752 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	OR52B2	Q96RD2	323 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	TP63	Q9H3D4	680 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	SLCO1B3	Q9NPD5	702 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	ACAD8	Q9UKU7	415 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	CENPE	Q02224	2701 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	C15orf38-AP3S2	A0A0A6YYH1	394 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	SLCO1B7	G3V0H7	640 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	BCKDK	O14874	412 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TPCN1-223	ENST00000552985	KCNK2	O95069	426 aa		10.24	□□□□□ -0.77

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