RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 FAM72AQ5TYM5 149 aa7.59□□□□□ -1.19
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PTPRB-209ENST00000550857 FAM72DQ6L9T8 149 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRB-209ENST00000550857 FAM72BQ86X60 149 aa7.59□□□□□ -1.19
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PTPRB-209ENST00000550857 NSMAFQ92636 917 aa7.58□□□□□ -1.2
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PTPRB-209ENST00000550857 MNTQ99583 582 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 SLC30A3Q99726 388 aa7.58□□□□□ -1.2
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PTPRB-209ENST00000550857 FGF22Q9HCT0 170 aa7.58□□□□□ -1.2
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