RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546048.5

MDM2-234, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 5

Gene MDM2, Length 363 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-234	ENST00000546048	NPIPA3	F8WFD2	350 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	SLC28A1	O00337	649 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	CCL21	O00585	134 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	TFEC	O14948	347 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	PLOD3	O60568	738 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	TSPAN2	O60636	221 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	G6PD	P11413	515 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	GP1BB	P13224	206 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	COX7A2	P14406	83 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	IL12A	P29459	219 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	MAP3K8	P41279	467 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	CASP3	P42574	277 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	FRK	P42685	505 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	TRPC1	P48995	793 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	NCBP2	P52298	156 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	DIO3	P55073	304 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	ABCE1	P61221	599 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	MAGOH	P61326	146 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	RPL38	P63173	70 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	PSG6	Q00889	435 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	ZNF763	Q0D2J5	394 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	BST1	Q10588	318 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	BIK	Q13323	160 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	GAB1	Q13480	694 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	PDE7A	Q13946	482 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	PTGR1	Q14914	329 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	HYAL4	Q2M3T9	481 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	GXYLT1	Q4G148	440 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	EIPR1	Q53HC9	387 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	TTMP	Q5BVD1	217 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	C6orf136	Q5SQH8	315 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	IL23R	Q5VWK5	629 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	SLC22A10	Q63ZE4	541 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	OR5M10	Q6IEU7	315 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	OPN5	Q6U736	354 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	RNF165	Q6ZSG1	346 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	FAM47E	Q6ZV65	393 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	TRIL	Q7L0X0	811 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	GALNT10	Q86SR1	603 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	NUDCD3	Q8IVD9	361 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	RIMKLA	Q8IXN7	391 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	GPALPP1	Q8IXQ4	340 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	CLYBL	Q8N0X4	340 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	OR2L13	Q8N349	312 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	FBXW8	Q8N3Y1	598 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	LIX1	Q8N485	282 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	WDSUB1	Q8N9V3	476 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	GOLM1	Q8NBJ4	401 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	OR7G1	Q8NGA0	311 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	OR5M9	Q8NGP3	310 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	ZNF675	Q8TD23	568 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	MGARP	Q8TDB4	240 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	RNF138	Q8WVD3	245 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	RNF141	Q8WVD5	230 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	PIK3R3	Q92569	461 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	EFHD2	Q96C19	240 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	OMA1	Q96E52	524 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	ELP4	Q96EB1	424 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	PGM2	Q96G03	612 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	SGCZ	Q96LD1	299 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	NPAS1	Q99742	590 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	FAM173A	Q9BQD7	235 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	YIPF4	Q9BSR8	244 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	FAIM2	Q9BWQ8	316 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	UBQLN3	Q9H347	655 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	WDR41	Q9HAD4	459 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	IL1RL2	Q9HB29	575 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	FOLH1B	Q9HBA9	442 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	PNPLA3	Q9NST1	481 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	SIRT3	Q9NTG7	399 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	TAS2R7	Q9NYW3	318 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	COPS7A	Q9UBW8	275 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	FBXL2	Q9UKC9	423 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	KLF13	Q9Y2Y9	288 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	MEMO1	Q9Y316	297 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	SLC6A5	Q9Y345	797 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	FAM215A	Q9Y5M1	114 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	KCNE3	Q9Y6H6	103 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	SEC23IP	Q9Y6Y8	1000 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	ZNF407	Q9C0G0	2248 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	ADGRG4	Q8IZF6	3080 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048		A0A1B0GVC2	190 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	TMEM120B	A0PK00	339 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	FRG2C	A6NGY1	282 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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