RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537686.5

GGA3-201, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGA3, Length 4,069 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-201ENST00000537686 CMAHPQ9Y471 501 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 CD8B2A6NJW9 211 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 CLCA1A8K7I4 914 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 NPIPA2E9PIF3 369 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 NPIPA3F8WFD2 350 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 NUDT7P0C024 238 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 CD8BP10966 210 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 BMXP51813 675 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 CDK5R2Q13319 367 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 SELPLGQ14242 412 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 FAM189A2Q15884 450 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 CCNJQ5T5M9 372 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 PGM2L1Q6PCE3 622 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 ZNF765Q7L2R6 523 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 TMPRSS12Q86WS5 348 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 OR6C4Q8NGE1 309 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 WDR20Q8TBZ3 569 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 CCDC107Q8WV48 283 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 TMEM168Q9H0V1 697 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 UCKL1Q9NWZ5 548 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 PFDN2Q9UHV9 154 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 USP22Q9UPT9 525 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 OTOFQ9HC10 1997 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 OR7A17O14581 309 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 ATP6V1G1O75348 118 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 GSTM2P28161 218 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 TNFRSF4P43489 277 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 STT3AP46977 705 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 CLRN1P58418 232 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 RPS15P62841 145 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 ZNF45Q02386 682 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 ACY1Q03154 408 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 MAP4K2Q12851 820 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 SYPL1Q16563 259 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 UGT8Q16880 541 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 CARD17Q5XLA6 110 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 PRSS48Q7RTY5 328 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 PRR22Q8IZ63 422 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 CENPSQ8N2Z9 138 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 OR2T4Q8NH00 348 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 SLC22A8Q8TCC7 542 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 WBP2Q969T9 261 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 PPP1R14BQ96C90 147 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 FRMD6Q96NE9 622 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 PHOX2BQ99453 314 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 C14orf119Q9NWQ9 140 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 C17orf105B2RV13 164 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 H0YIV9 168 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 SEC14L5O43304 696 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 GKN3PP0CG01 181 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 NFATC3Q12968 1075 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 RPE65Q16518 533 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 ABCA11PQ4W5N1 156 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 TMEFF1Q8IYR6 380 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 NLGN4XQ8N0W4 816 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 ZNF559Q9BR84 538 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 GORASP2Q9H8Y8 452 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 TBX21Q9UL17 535 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 C12orf71A8MTZ7 269 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 OTX2P32243 289 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 ADH7P40394 386 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 GALK2Q01415 458 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 PLP2Q04941 152 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 GBX1Q14549 363 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 GPR149Q86SP6 731 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 FAM217AQ8IXS0 508 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 CCDC36Q8IYA8 594 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 SLC37A3Q8NCC5 494 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 CCDC54Q8NEL0 328 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 TANKQ92844 425 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 DHRS1Q96LJ7 313 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 PADI2Q9Y2J8 665 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 NOX1Q9Y5S8 564 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 LOC285556D6RIA3 1793 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 TRAV6A0A075B6T7 132 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 SH3D21A4FU49 640 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 HTR3EA5X5Y0 456 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 NDUFB2O95178 105 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 RLN2P04090 185 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 CPOXP36551 454 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 PRKXP51817 358 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 EMP2P54851 167 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 GABARAPL2P60520 117 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms