RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 FABP1P07148 127 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 OR56A5P0C7T3 313 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 BCKDHAP12694 445 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 SPAM1P38567 509 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 BLKP51451 505 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 BTG1P62324 171 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 OPCMLQ14982 345 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 IER5LQ5T953 404 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM215Q68D42 235 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 FAM151BQ6UXP7 276 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 LAS2Q8IYD9 372 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 FAM9CQ8IZT9 166 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 BVESQ8NE79 360 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 PIH1D2Q8WWB5 315 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 SLC6A18Q96N87 628 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 SLC17A9Q9BYT1 436 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 SLC19A3Q9BZV2 496 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 NLGN3Q9NZ94 848 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 LHX3Q9UBR4 397 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 CUL9Q8IWT3 2517 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 PLXNA3P51805 1871 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 SHISA3A0PJX4 238 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 IGLON5A6NGN9 336 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 RFXANKO14593 260 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 SIX6O95475 246 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 FGF2P09038 288 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 ENGP17813 658 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 GABRG2P18507 467 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 GDF5P43026 501 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 DEFA5Q01523 94 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 ST3GAL2Q16842 350 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 UAP1L1Q3KQV9 507 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 KIAA1211LQ6NV74 962 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 SFTPA1Q8IWL2 248 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 ZFP41Q8N8Y5 198 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 MOSPD2Q8NHP6 518 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 SLC38A2Q96QD8 506 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 DDOQ99489 341 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 ZSCAN32Q9NX65 697 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 MLXQ9UH92 298 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 HCN2Q9UL51 889 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 PRKAB1Q9Y478 270 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 NIPSNAP2O75323 286 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 ACPPP15309 386 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 TRIM23P36406 574 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 CASP9P55211 416 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 PPP3R1P63098 170 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 TCEA2Q15560 299 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 C3P1Q6ZMU1 363 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 KRT74Q7RTS7 529 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF683Q8IZ20 524 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 PPP3R2Q96LZ3 170 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 KCTD7Q96MP8 289 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 WDR26Q9H7D7 661 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 NT5DC2Q9H857 520 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 IPPKQ9H8X2 491 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 ARNT2Q9HBZ2 717 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 CLN6Q9NWW5 311 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 POFUT2Q9Y2G5 429 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 CLIC1O00299 241 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 CLDN7O95471 211 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 DHFRP00374 187 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 S100A3P33764 101 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 RGRP47804 291 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 BLVRAP53004 296 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 SPIBQ01892 262 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM88Q6PEY1 159 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM92Q6UXU6 159 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 UNC5DQ6UXZ4 953 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM163Q8TC26 289 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 LRRC46Q96FV0 321 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 SCRN2Q96FV2 425 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 ATF6BQ99941 703 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 EVA1AQ9H8M9 152 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 TAS2R13Q9NYV9 303 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 FZD4Q9ULV1 537 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 PLCL2Q9UPR0 1127 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 PRAMEF25A6NGN4 478 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 PAPLNO95428 1278 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 TRBC1P01850 177 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 CXCL2P19875 107 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 STC1P52823 247 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 CDC42P60953 191 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 TSPAN5P62079 268 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms