RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-222ENST00000514552 ELP5Q8TE02 316 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-222ENST00000514552 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-222ENST00000514552 C14orf79Q96F83 325 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-222ENST00000514552 SERPINB12Q96P63 405 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-222ENST00000514552 LPAR4Q99677 370 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-222ENST00000514552 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-222ENST00000514552 HAUS8Q9BT25 410 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-222ENST00000514552 PARVBQ9HBI1 364 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-222ENST00000514552 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-222ENST00000514552 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-222ENST00000514552 GALPQ9UBC7 116 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-222ENST00000514552 GUCA1BQ9UMX6 200 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-222ENST00000514552 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-222ENST00000514552 NME2P1O60361 137 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-222ENST00000514552 NEURL1O76050 574 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-222ENST00000514552 TTC4O95801 387 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-222ENST00000514552 SYF2O95926 243 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-222ENST00000514552 TK1P04183 234 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-222ENST00000514552 FHP07954 510 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-222ENST00000514552 CCDC175P0C221 793 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF24P17028 368 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-222ENST00000514552 IL1RNP18510 177 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-222ENST00000514552 CSNK1G2P78368 415 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-222ENST00000514552 ADORA2A-AS1P86434 159 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-222ENST00000514552 CUL1Q13616 776 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-222ENST00000514552 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-222ENST00000514552 ABRAXAS2Q15018 415 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-222ENST00000514552 SFT2D3Q587I9 215 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-222ENST00000514552 C10orf25Q5T742 122 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-222ENST00000514552 MFSD4BQ5TF39 518 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-222ENST00000514552 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF549Q6P9A3 640 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-222ENST00000514552 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-222ENST00000514552 AGTRAPQ6RW13 159 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-222ENST00000514552 CES3Q6UWW8 571 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-222ENST00000514552 SPNS3Q6ZMD2 512 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-222ENST00000514552 QSOX2Q6ZRP7 698 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-222ENST00000514552 LANCL3Q6ZV70 420 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-222ENST00000514552 MDGA2Q7Z553 956 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-222ENST00000514552 ASPGQ86U10 573 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-222ENST00000514552 CRLF3Q8IUI8 442 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-222ENST00000514552 DENND6AQ8IWF6 608 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-222ENST00000514552 CNTN4Q8IWV2 1026 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-222ENST00000514552 TBC1D19Q8N5T2 526 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-222ENST00000514552 MFSD9Q8NBP5 474 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-222ENST00000514552 PPFIBP2Q8ND30 876 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-222ENST00000514552 OR4K1Q8NGD4 311 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-222ENST00000514552 SLC13A3Q8WWT9 602 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-222ENST00000514552 ATL1Q8WXF7 558 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-222ENST00000514552 TRIM63Q969Q1 353 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-222ENST00000514552 PRAP1Q96NZ9 151 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-222ENST00000514552 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-222ENST00000514552 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-222ENST00000514552 GPR21Q99679 349 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-222ENST00000514552 TMEM79Q9BSE2 394 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-222ENST00000514552 TRIM51Q9BSJ1 452 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-222ENST00000514552 NAT9Q9BTE0 207 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-222ENST00000514552 KCNK13Q9HB14 408 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-222ENST00000514552 TMEM45AQ9NWC5 275 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-222ENST00000514552 TAS2R13Q9NYV9 303 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-222ENST00000514552 HCN3Q9P1Z3 774 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-222ENST00000514552 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-222ENST00000514552 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-222ENST00000514552 MEMO1Q9Y316 297 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-222ENST00000514552 CACNA1CQ13936 2221 aa6.27□□□□□ -1.4
PDE4D-222ENST00000514552 PCNX1Q96RV3 2341 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-222ENST00000514552 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-222ENST00000514552 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-222ENST00000514552 TRBC2A0A5B9 178 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-222ENST00000514552 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-222ENST00000514552 URADA6NGE7 173 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-222ENST00000514552 SAGE2PA6NJ88 616 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-222ENST00000514552 GABRR3A8MPY1 467 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-222ENST00000514552 A8MUI8 341 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-222ENST00000514552 SGK494L7N484 410 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-222ENST00000514552 NDUFS4O43181 175 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-222ENST00000514552 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-222ENST00000514552 AVILO75366 819 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-222ENST00000514552 RDH16O75452 317 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-222ENST00000514552 SLC25A12O75746 678 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-222ENST00000514552 KRT38O76015 456 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-222ENST00000514552 TSPAN12O95859 305 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-222ENST00000514552 F10P00742 488 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-222ENST00000514552 SP1P08047 785 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-222ENST00000514552 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-222ENST00000514552 CHN1P15882 459 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-222ENST00000514552 ALOX12P18054 663 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-222ENST00000514552 PGAM1P18669 254 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-222ENST00000514552 HIST1H2ADP20671 130 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-222ENST00000514552 GSTM2P28161 218 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-222ENST00000514552 AHRP35869 848 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-222ENST00000514552 KCNJ1P48048 391 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-222ENST00000514552 CYB561P49447 251 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-222ENST00000514552 CCR8P51685 355 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-222ENST00000514552 SLC26A5P58743 744 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-222ENST00000514552 PMP22Q01453 160 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-222ENST00000514552 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-222ENST00000514552 CRYMQ14894 314 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-222ENST00000514552 NSDHLQ15738 373 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-222ENST00000514552 C3AR1Q16581 482 aa6.27□□□□□ -1.41
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