RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504295.1

COPB2-204, Transcript of coatomer protein complex subunit beta 2, humanhuman

TSL 2

Gene COPB2, Length 3,524 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2-204ENST00000504295 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 FKBP7Q9Y680 259 aa5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 A0A0A6YYJ9 748 aa5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 IRGMA1A4Y4 181 aa5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 GOLGA8CPA6NN73 597 aa5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 PTGES3LE9PB15 166 aa5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 LDLRAD4O15165 306 aa5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 B3GALNT1O75752 331 aa5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 DPP4P27487 766 aa5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 MC1RQ01726 317 aa5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 TOMM20Q15388 145 aa5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 FDX2Q6P4F2 183 aa5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 CCDC81Q6ZN84 652 aa5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 FRRS1Q6ZNA5 592 aa5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 Q6ZSR3 168 aa5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 OR52H1Q8NGJ2 320 aa5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 RSC1A1Q92681 617 aa5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 SLC25A38Q96DW6 304 aa5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 COPS8Q99627 209 aa5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 TSSK6Q9BXA6 273 aa5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 EBPLQ9BY08 206 aa5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 PIGUQ9H490 435 aa5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 BRD9Q9H8M2 597 aa5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 ADAM30Q9UKF2 790 aa5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 PILRAQ9UKJ1 303 aa5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 NUP50Q9UKX7 468 aa5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 GPR89AB7ZAQ6 455 aa5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 H3BMH7 237 aa5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 WWP2O00308 870 aa5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 SLC19A2O60779 497 aa5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 TBL1XO60907 577 aa5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 NOL3O60936 208 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 GPR89BP0CG08 455 aa5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 EPCAMP16422 314 aa5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 HLA-GP17693 338 aa5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 PSMB9P28065 219 aa5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 HTR2AP28223 471 aa5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 TRIM23P36406 574 aa5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 NRG3P56975 720 aa5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 TBRG1Q3YBR2 411 aa5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 KLHL26Q53HC5 615 aa5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 TMEM255AQ5JRV8 349 aa5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 TOR2AQ5JU69 321 aa5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 GARNL3Q5VVW2 1013 aa5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 NHLRC1Q6VVB1 395 aa5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 ADCK1Q86TW2 530 aa5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 SYT14Q8NB59 555 aa5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 SMRP1Q8NCR6 262 aa5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 OR5K2Q8NHB8 316 aa5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 LHFPL5Q8TAF8 219 aa5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 EXT2Q93063 718 aa5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 GLYATL1Q969I3 302 aa5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 TMEM19Q96HH6 336 aa5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 ZNF350Q9GZX5 532 aa5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 ABCG5Q9H222 651 aa5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 TBC1D14Q9P2M4 693 aa5.95□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa5.94□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 TRBC2A0A5B9 178 aa5.94□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 CIB4A0PJX0 185 aa5.94□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 TSPAN3O60637 253 aa5.94□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 TRIM16O95361 564 aa5.94□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 LYL1P12980 280 aa5.94□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 FCARP24071 287 aa5.94□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 PDHA2P29803 388 aa5.94□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 TALDO1P37837 337 aa5.94□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 DSTNP60981 165 aa5.94□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 GPR176Q14439 515 aa5.94□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 TATDN3Q17R31 274 aa5.94□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 METRNLQ641Q3 311 aa5.94□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 MTSS1LQ765P7 747 aa5.94□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 TPRA1Q86W33 373 aa5.94□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 AMER3Q8N944 861 aa5.94□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 CHST14Q8NCH0 376 aa5.94□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 THAP4Q8WY91 577 aa5.94□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 SUSD6Q92537 303 aa5.94□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 FOXJ1Q92949 421 aa5.94□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 MOAP1Q96BY2 351 aa5.94□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 HDAC8Q9BY41 377 aa5.94□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 S1PR5Q9H228 398 aa5.94□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 GLIPR2Q9H4G4 154 aa5.94□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 DLL4Q9NR61 685 aa5.94□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 C14orf119Q9NWQ9 140 aa5.94□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa5.94□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 V9GYQ6 96 aa5.94□□□□□ -1.46
COPB2-204ENST00000504295 A0A1B0GTI1 187 aa5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms