RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496549.5

CRNKL1-205, Transcript of crooked neck pre-mRNA splicing factor 1, human

TSL 1 (best)

Gene CRNKL1, Length 4,093 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CRNKL1-205	ENST00000496549	IFNG	P01579	166 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	CPE	P16870	476 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	SMPD1	P17405	629 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	CTPS1	P17812	591 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	FGF7	P21781	194 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	GABRR2	P28476	465 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	MAT2A	P31153	395 aa	Known RBP	7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC11A2	P49281	568 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	DGKG	P49619	791 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	ADIG	Q0VDE8	80 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	CNTN1	Q12860	1018 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	ECH1	Q13011	328 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	MTFR2	Q6P444	385 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	HTR3D	Q70Z44	454 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR4L1	Q8NH43	312 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	C1GALT1	Q9NS00	363 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	FBXL21	Q9UKT6	434 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	NOP16	Q9Y3C1	178 aa	Known RBP	7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	KPTN	Q9Y664	436 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A087WZY1	265 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	GABRP	O00591	440 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	UBE2C	O00762	179 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	ARL6IP5	O75915	188 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	F10	P00742	488 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	OSM	P13725	252 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	HOXA9	P31269	272 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	PBX3	P40426	434 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	SKP2	Q13309	424 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	THEM4	Q5T1C6	240 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	NCMAP	Q5T1S8	102 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR4F3	Q6IEY1	312 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	ARL9	Q6T311	187 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	SUSD1	Q6UWL2	747 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	SPIC	Q8N5J4	248 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	APOLD1	Q96LR9	279 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	GPR21	Q99679	349 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	FNDC11	Q9BVV2	318 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	CHRD	Q9H2X0	955 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	POT1	Q9NUX5	634 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF226	Q9NYT6	803 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR12D3	Q9UGF7	316 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	SNX11	Q9Y5W9	270 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	TJP1	Q07157	1748 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	TGOLN2	O43493	480 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	FKTN	O75072	461 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	S1PR4	O95977	384 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	PNP	P00491	289 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	IL3	P08700	152 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	GDNF	P39905	211 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR1E2	P47887	323 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	SELENOP	P49908	381 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	VEZF1	Q14119	521 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	SERTAD2	Q14140	314 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	MARC1	Q5VT66	337 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	KRTCAP2	Q8N6L1	136 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	COA1	Q9GZY4	146 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	PORCN	Q9H237	461 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	HRH4	Q9H3N8	390 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	MRPS30	Q9NP92	439 aa	Known RBP	7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	NLE1	Q9NVX2	485 aa	Predicted RBP	7.74	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	ASPDH	A6ND91	283 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	SEPT4	O43236	478 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	HP	P00738	406 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	GNRH1	P01148	92 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRPS1L1	P21108	318 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	ITGA3	P26006	1051 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	PLA2G7	Q13093	441 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	DOC2A	Q14183	400 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	GINS1	Q14691	196 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR8G1	Q15617	311 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC5A12	Q1EHB4	618 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	ABHD13	Q7L211	337 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR14K1	Q8NGZ2	314 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CRNKL1-205	ENST00000496549	SNIP1	Q8TAD8	396 aa	Known RBP	7.73	□□□□□ -1.17

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