RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 COL26A1Q96A83 441 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 SIPA1Q96FS4 1042 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 DMRTB1Q96MA1 342 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 PITX2Q99697 317 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 PRR14Q9BWN1 585 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ASCL3Q9NQ33 180 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 MAT2BQ9NZL9 334 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 POFUT2Q9Y2G5 429 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 A0A1W2PR48 441 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 LRRC72A6NJI9 287 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 CENPXA8MT69 81 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 H3BN98 237 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 BTN3A3O00478 584 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 SEMA7AO75326 666 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ZNF254O75437 659 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 SCO1O75880 301 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 M6PRP20645 277 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 PKLRP30613 574 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ACSL1P33121 698 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 OPRL1P41146 370 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ACTR1BP42025 376 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ACTR1AP61163 376 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 SLC9A5Q14940 896 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 PCSK4Q6UW60 755 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 BTLAQ7Z6A9 289 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ACOT4Q8N9L9 421 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 OR2L3Q8NG85 312 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 OR1E3Q8WZA6 343 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 C16orf58Q96GQ5 468 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 SLC35G5Q96KT7 338 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 LRFN5Q96NI6 719 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 GABARAPL3Q9BY60 117 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 NEUROD4Q9HD90 331 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 THSD1Q9NS62 852 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 SEMA3GQ9NS98 782 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 RGS13O14921 159 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 FRS3O43559 492 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 CLEC3AO75596 197 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 DNAJB5O75953 348 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 RASGRP1O95267 797 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 RHCEP18577 417 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 CXCR4P61073 352 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 SEC23BQ15437 767 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 TCTN3Q6NUS6 607 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 TMEM107Q6UX40 140 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 COMTD1Q86VU5 262 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 LILRB2Q8N423 598 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 STX19Q8N4C7 294 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 OR10G6Q8NH81 332 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 RHOXF1Q8NHV9 184 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ANGPTL6Q8NI99 470 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 GGHQ92820 318 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 KAT2AQ92830 837 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 MS4A6EQ96DS6 147 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 AMDHD1Q96NU7 426 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 PSD2Q9BQI7 771 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 TIMM29Q9BSF4 260 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 TMEM168Q9H0V1 697 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ZNF226Q9NYT6 803 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 A0A0A6YYD5 115 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 PRSS38A1L453 326 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 CEACAM4O75871 244 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 NAGAP17050 411 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 TNNI3P19429 210 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 PTNP21246 168 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 CHMP24386 653 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 NTSP30990 170 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 LIPAP38571 399 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 CLK1P49759 484 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 SEPHS1P49903 392 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 CRISP3P54108 245 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 KCNC4Q03721 635 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 SPEM2Q0P670 501 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ST3GAL4Q11206 333 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 COX10Q12887 443 aa6.57□□□□□ -1.36
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