RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491292.5

ERCC3-208, Transcript of ERCC excision repair 3, TFIIH core complex helicase subunit, human

TSL 2

Gene ERCC3, Length 4,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERCC3-208	ENST00000491292	CD93	Q9NPY3	652 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	SCML1	Q9UN30	329 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	YIPF1	Q9Y548	306 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	DOCK1	Q14185	1865 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	CKB	P12277	381 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	HK1	P19367	917 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	GSTM3	P21266	225 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	NUDT1	P36639	197 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	SOX2	P48431	317 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	VEGFC	P49767	419 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	MVD	P53602	400 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	ERVFC1	P60507	584 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	TCTE1	Q5JU00	501 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	CDKL4	Q5MAI5	379 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	GDPD4	Q6W3E5	623 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	RNF44	Q7L0R7	432 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	PRICKLE2	Q7Z3G6	844 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	AIF1L	Q9BQI0	150 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	NDC1	Q9BTX1	674 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	SLC25A18	Q9H1K4	315 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	XKR8	Q9H6D3	395 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	SH2B3	Q9UQQ2	575 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	URB1	O60287	2271 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292		A0A1W2PRU2	124 aa		9.24	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		9.24	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	LRG1	P02750	347 aa		9.24	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	MPC1L	P0DKB6	136 aa		9.24	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	RPL4	P36578	427 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	CLDN2	P57739	230 aa		9.24	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	MPPE1	Q53F39	396 aa		9.24	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	C18orf63	Q68DL7	685 aa		9.24	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		9.24	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	TMEM107	Q6UX40	140 aa		9.24	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	QSOX2	Q6ZRP7	698 aa		9.24	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	VRK2	Q86Y07	508 aa		9.24	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	GPR32P1	Q8NGA4	272 aa		9.24	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		9.24	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	OR6K6	Q8NGW6	343 aa		9.24	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	OR8S1	Q8NH09	359 aa		9.24	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	WDR20	Q8TBZ3	569 aa		9.24	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	TRAF4	Q9BUZ4	470 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	FKBP7	Q9Y680	259 aa		9.24	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	TRBV23OR9-2	A0A075B6M9	112 aa		9.24	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		9.24	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	TRIM3	O75382	744 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	LEFTY1	O75610	366 aa		9.24	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	POP7	O75817	140 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	PTHLH	P12272	177 aa		9.24	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	ACP5	P13686	325 aa		9.24	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	PSMB5	P28074	263 aa		9.24	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	TRIM23	P36406	574 aa		9.24	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	STAT5A	P42229	794 aa		9.24	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	FLT3LG	P49771	235 aa		9.24	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	ID2	Q02363	134 aa		9.24	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	SP140	Q13342	867 aa		9.24	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	TP53I3	Q53FA7	332 aa		9.24	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	TIGD3	Q6B0B8	471 aa		9.24	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	METTL2B	Q6P1Q9	378 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		9.24	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	FBXW5	Q969U6	566 aa		9.24	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		9.24	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		9.24	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	DPH1	Q9BZG8	443 aa		9.24	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	CDH10	Q9Y6N8	788 aa		9.24	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	C1S	P09871	688 aa		9.24	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	PIP	P12273	146 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	M6PR	P20645	277 aa		9.24	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	ERVK-25	P63136	954 aa		9.24	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		9.24	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	C4orf46	Q504U0	113 aa		9.24	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		9.24	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	LIPI	Q6XZB0	460 aa		9.24	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	GET4	Q7L5D6	327 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		9.24	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		9.24	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	OR4D11	Q8NGI4	311 aa		9.24	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	OR5P2	Q8WZ92	322 aa		9.24	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	UCN3	Q969E3	161 aa		9.24	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		9.24	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	NT5DC2	Q9H857	520 aa		9.24	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	LCT	P09848	1927 aa		9.24	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292		A0A1B0GVT2	93 aa		9.23	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	PDCD5	O14737	125 aa		9.23	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	RASGRP1	O95267	797 aa		9.23	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	HSD3B1	P14060	373 aa		9.23	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	FUT1	P19526	365 aa		9.23	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	RAB3B	P20337	219 aa		9.23	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	HSD3B2	P26439	372 aa		9.23	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	AGFG1	P52594	562 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	MGAT3	Q09327	533 aa		9.23	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	CRHR2	Q13324	411 aa		9.23	□□□□□ -0.93

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