RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489741.1

PRPF40A-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF40A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-210ENST00000489741 BLOC1S1P78537 153 aa5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 DR1Q01658 176 aa5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 PLGLB1Q02325 96 aa5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 STX4Q12846 297 aa5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 DLG1Q12959 904 aa5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 CHIT1Q13231 466 aa5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 PDK4Q16654 411 aa5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 FBXO48Q5FWF7 155 aa5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 ARSKQ6UWY0 536 aa5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 FAM47EQ6ZV65 393 aa5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 ISCA2Q86U28 154 aa5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 C9orf40Q8IXQ3 194 aa5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 CLYBLQ8N0X4 340 aa5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 OR7G3Q8NG95 312 aa5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 CCT6BQ92526 530 aa5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 NRGNQ92686 78 aa5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 TANKQ92844 425 aa5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 RUNDC3BQ96NL0 473 aa5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 GPR22Q99680 433 aa5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 FOXC2Q99958 501 aa5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF559Q9BR84 538 aa5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 CNPPD1Q9BV87 410 aa5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 OR8D2Q9GZM6 311 aa5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 ROGDIQ9GZN7 287 aa5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 CAB39LQ9H9S4 337 aa5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 SACM1LQ9NTJ5 587 aa5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 QPCTLQ9NXS2 382 aa5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 FAM30AQ9NZY2 134 aa5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 SPRR3Q9UBC9 169 aa5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 IKBKGQ9Y6K9 419 aa5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 LRRC3CA6NJW4 275 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 FAM159BA6NKW6 160 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 WASHC1A8K0Z3 465 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 RTCAO00442 366 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 ZSCAN12O43309 604 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 PROM1O43490 865 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 ERN1O75460 977 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 ATP6AP2O75787 350 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 PRSS23O95084 383 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 NUDT3O95989 172 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 CLPSP04118 112 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 P04436 131 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 ELANEP08246 267 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 GABRA1P14867 456 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 TNNI3P19429 210 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 SERPINB1P30740 379 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 GALNSP34059 522 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 PIK3CBP42338 1070 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 MSH2P43246 934 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC37A1P57057 533 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 GPX6P59796 221 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 ID2Q02363 134 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 IRF8Q02556 426 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 TGM3Q08188 693 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 ASPHQ12797 758 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 AP5B1Q2VPB7 878 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 PAGE2BQ5JRK9 111 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 C1orf185Q5T7R7 199 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC22A10Q63ZE4 541 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 C18orf63Q68DL7 685 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 OR4C11Q6IEV9 310 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 FRA10AC1Q70Z53 315 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 OR4N5Q8IXE1 308 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 KLHL7Q8IXQ5 586 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 ZBED8Q8IZ13 594 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 FBXW8Q8N3Y1 598 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 FITM2Q8N6M3 262 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF441Q8N8Z8 693 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 MYRIPQ8NFW9 859 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 NEIL3Q8TAT5 605 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 TBC1D15Q8TC07 691 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 PYROXD1Q8WU10 500 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 UBTD2Q8WUN7 234 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 SARAFQ96BY9 339 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 CMTM7Q96FZ5 175 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 FBXL20Q96IG2 436 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 ATOH8Q96SQ7 321 aa5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms