RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 SNPHO15079 494 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 HDAC3O15379 428 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP11.49□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 CD99P14209 185 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 HMOX2P30519 316 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 EMDP50402 254 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 RPP38P78345 283 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 SRYQ05066 204 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 BTKQ06187 659 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 PLCXD2Q0VAA5 305 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 FOXF2Q12947 444 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 NUP54Q7Z3B4 507 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 SPATA21Q7Z572 469 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 MED12LQ86YW9 2145 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 WDSUB1Q8N9V3 476 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 TWIST2Q8WVJ9 160 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 KAT2AQ92830 837 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 CTHRC1Q96CG8 243 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 HSPBAP1Q96EW2 488 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 FOXC2Q99958 501 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 TUBA1CQ9BQE3 449 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 NUF2Q9BZD4 464 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 KLRF1Q9NZS2 232 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 DCTN4Q9UJW0 460 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 ABCA4P78363 2273 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 PRAMEF25A6NGN4 478 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 CD8B2A6NJW9 211 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 B4DXG7 233 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 SLCO1B7G3V0H7 640 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 PIP5K1BO14986 540 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 SNX3O60493 162 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 KRT6AP02538 564 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 KRT6BP04259 564 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 KLK2P20151 261 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 CTSSP25774 331 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 KRT6CP48668 564 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 STARP49675 285 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 AQP5P55064 265 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 CORO7P57737 925 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 RAE1P78406 368 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 OR5M10Q6IEU7 315 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 SLC30A6Q6NXT4 461 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 EPGNQ6UW88 154 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 SCIMPQ6UWF3 145 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 PIGWQ7Z7B1 504 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 CCDC116Q8IYX3 515 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 OR14L1PQ8NHC6 308 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 FAM222BQ8WU58 562 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 C10orf82Q8WW14 230 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 NINJ1Q92982 152 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 TMBIM1Q969X1 311 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 C3orf30Q96M34 536 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 G6PC3Q9BUM1 346 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 CALHM2Q9HA72 323 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 BRF2Q9HAW0 419 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 PFDN4Q9NQP4 134 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 KLHL14Q9P2G3 628 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 VPS29Q9UBQ0 182 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 FBXL2Q9UKC9 423 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 UTS2RQ9UKP6 389 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 SNX6Q9UNH7 406 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 VPS13CQ709C8 3753 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 PCNX3Q9H6A9 2034 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 TUBAL3A6NHL2 446 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 SDHDO14521 159 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 GUCY1B2O75343 617 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 REM1O75628 298 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 CHEK2O96017 543 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 IL3P08700 152 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 LINC00032P0C843 101 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 CYP4B1P13584 511 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 NAGAP17050 411 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 DRD5P21918 477 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 PPICP45877 212 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 IDH3AP50213 366 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 PRSS53Q2L4Q9 553 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 ZNF628Q5EBL2 1059 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 XKR7Q5GH72 579 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 TMEM81Q6P7N7 255 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 NPSR1Q6W5P4 371 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 RNF165Q6ZSG1 346 aa11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms