RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480273.5

RTEL1-TNFRSF6B-201, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,751 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ITGAMP11215 1152 aa16.26■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HMGCLP35914 325 aa16.26■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NKPD1Q17RQ9 610 aa16.26■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TP53I3Q53FA7 332 aa16.26■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RAB41Q5JT25 222 aa16.26■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DEFB119Q8N690 84 aa16.26■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa16.26■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CHPT1Q8WUD6 406 aa16.26■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KLHL15Q96M94 604 aa16.26■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GPR62Q9BZJ7 368 aa16.26■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LDAHQ9H6V9 325 aa16.26■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RIMS3Q9UJD0 308 aa16.26■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DIRAS3O95661 229 aa16.26■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PCGF2P35227 344 aa16.26■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMEM130Q8N3G9 435 aa16.26■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DHRS4Q9BTZ2 278 aa16.26■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ICKQ9UPZ9 632 aa16.26■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TRAPPC13A5PLN9 417 aa16.26■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CDK2P24941 298 aa16.26■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DLSTP36957 453 aa16.26■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SNU13P55769 128 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa16.26■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DPH1Q9BZG8 443 aa16.26■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FN3KQ9H479 309 aa16.26■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SPHK2Q9NRA0 654 aa16.26■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GPR37L1O60883 481 aa16.25■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF623O75123 536 aa16.25■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TSPAN15O95858 294 aa16.25■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MSL3P1P0C860 447 aa16.25■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BORAQ6PGQ7 559 aa16.25■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMEM150AQ86TG1 271 aa16.25■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PARP16Q8N5Y8 322 aa16.25■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SNAPC3Q92966 411 aa16.25■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 STRA6Q9BX79 667 aa16.25■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MVB12BQ9H7P6 319 aa16.25■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BIN3Q9NQY0 253 aa16.25■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC7A7Q9UM01 511 aa16.25■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PGCP20142 388 aa16.25■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RNF111Q6ZNA4 994 aa16.25■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CPOQ8IVL8 374 aa16.25■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PNPLA1Q8N8W4 532 aa16.25■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR2T4Q8NH00 348 aa16.25■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SSX3Q99909 188 aa16.25■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CD300AQ9UGN4 299 aa16.25■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HPGDSO60760 199 aa16.25■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IFNA17P01571 189 aa16.25■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 WNT7BP56706 349 aa16.25■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF691Q5VV52 312 aa16.25■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CPZQ66K79 652 aa16.25■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CRYGNQ8WXF5 182 aa16.25■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF442Q9H7R0 627 aa16.25■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMEM45AQ9NWC5 275 aa16.25■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IL37Q9NZH6 218 aa16.25■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 VAPAQ9P0L0 249 aa16.25■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C5AR2Q9P296 337 aa16.25■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EMCNQ9ULC0 261 aa16.25■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa16.25■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC2A5P22732 501 aa16.25■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PRSS3P35030 304 aa16.25■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 POU3F4P49335 361 aa16.25■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR51L1Q8NGJ5 315 aa16.25■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 STK35Q8TDR2 534 aa16.25■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAM83CQ9BQN1 747 aa16.25■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC12A9Q9BXP2 914 aa16.25■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF35P13682 527 aa16.24■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RPS21P63220 83 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PLP2Q04941 152 aa16.24■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ACTRT3Q9BYD9 372 aa16.24■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NAP1L6A6NFF2 107 aa16.24■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 STC2O76061 302 aa16.24■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CD200R1Q8TD46 325 aa16.24■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PAAF1Q9BRP4 392 aa16.24■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa16.24■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 THEGLP0DJG4 465 aa16.24■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IFNGR1P15260 489 aa16.24■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RANBP10Q6VN20 620 aa16.24■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF440Q8IYI8 595 aa16.24■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 APCDD1Q8J025 514 aa16.24■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa16.24■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 REV1Q9UBZ9 1251 aa16.24■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BTNL2Q9UIR0 455 aa16.24■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NHSQ6T4R5 1651 aa16.24■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DYRK1AQ13627 763 aa16.24■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ACBD4Q8NC06 268 aa16.24■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LRIG1Q96JA1 1093 aa16.24■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa16.24■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RNF215Q9Y6U7 377 aa16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70 ms