RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449757.5

DDX39B-211, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 3

Gene DDX39B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-211ENST00000449757 SNX6Q9UNH7 406 aa9.28□□□□□ -0.92
DDX39B-211ENST00000449757 EMC9Q9Y3B6 208 aa9.28□□□□□ -0.92
DDX39B-211ENST00000449757 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 RNF212BA8MTL3 300 aa9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 PCDH7O60245 1069 aa9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 TSPAN2O60636 221 aa9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 OTCP00480 354 aa9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 RBP1P09455 135 aa9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 CT45A8P0DMV1 189 aa9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 CT45A9P0DMV2 189 aa9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 CTBP2P56545 445 aa9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 CLDN20P56880 219 aa9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 CAV1Q03135 178 aa9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 GANABQ14697 944 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 BCL2A1Q16548 175 aa9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 GGTA1PQ4G0N0 100 aa9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 CT45A2Q5DJT8 189 aa9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 LGSNQ5TDP6 509 aa9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 FAM9CQ8IZT9 166 aa9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 OR2M3Q8NG83 312 aa9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 OR4N2Q8NGD1 307 aa9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 TRPC4APQ8TEL6 797 aa9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 CAVIN3Q969G5 261 aa9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 PLPPR2Q96GM1 343 aa9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 GPR78Q96P69 363 aa9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 KCNF1Q9H3M0 494 aa9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 PTGES2Q9H7Z7 377 aa9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 ZBTB26Q9HCK0 441 aa9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 TMCO1Q9UM00 188 aa9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 CLEC4AQ9UMR7 237 aa9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF337Q9Y3M9 751 aa9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF175Q9Y473 711 aa9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 OR2M5A3KFT3 312 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 B4DXG7 233 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 SHISA8B8ZZ34 492 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 RNF223E7ERA6 249 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 STX16O14662 325 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 HS3ST1O14792 307 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 COQ9O75208 318 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 CRLF1O75462 422 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 TNFRSF21O75509 655 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 PLAUP00749 431 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 CGAP01215 116 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 TP53P04637 393 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 CD8BP10966 210 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 LOXP28300 417 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 CLK3P49761 638 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 PNLIPRP2P54317 469 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 GAS1P54826 345 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 CDH13P55290 713 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 CLDN15P56746 228 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 PSPHP78330 225 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 TNK1Q13470 666 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 LETMD1Q6P1Q0 360 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 C22orf34Q6ZV56 151 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 CEP112Q8N8E3 955 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 FADS6Q8N9I5 356 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 MARK4Q96L34 752 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 VSTM2LQ96N03 204 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF681Q96N22 645 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 BBS4Q96RK4 519 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 EBPLQ9BY08 206 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 RAB17Q9H0T7 212 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 RNF122Q9H9V4 155 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 BRF2Q9HAW0 419 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 FANCFQ9NPI8 374 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 SDHAF3Q9NRP4 125 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 TAS2R9Q9NYW1 312 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 FLRT3Q9NZU0 649 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 RNF14Q9UBS8 474 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 MCM8Q9UJA3 840 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 LAMP3Q9UQV4 416 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 MXRA5Q9NR99 2828 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 HMX2A2RU54 273 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 PPP6CO00743 305 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 CLOCKO15516 846 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 AQP8O94778 261 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 OR4F21O95013 312 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 THBDP07204 575 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 INHBAP08476 426 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 RPS17P08708 135 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 PPP3CBP16298 524 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 HMOX2P30519 316 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 PHBP35232 272 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 PCYT1AP49585 367 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 BTKQ06187 659 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 DECR1Q16698 335 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 CLEC12BQ2HXU8 276 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa9.25□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.9 ms