RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449058.6

TOM1-210, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOM1, Length 2,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1-210	ENST00000449058	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		15.83	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	CDC73	Q6P1J9	531 aa		15.83	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	CD200R1L	Q6Q8B3	271 aa		15.83	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	DGLUCY	Q7Z3D6	616 aa		15.83	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		15.83	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	LRRC25	Q8N386	305 aa	Predicted RBP	15.83	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	SCAI	Q8N9R8	606 aa		15.83	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		15.83	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	MS4A4E	Q96PG1	132 aa		15.83	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	FCRL4	Q96PJ5	515 aa		15.83	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	HOXD1	Q9GZZ0	328 aa		15.83	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	SLC6A17	Q9H1V8	727 aa		15.83	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		15.83	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		15.83	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	BTN3A3	O00478	584 aa		15.83	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	AP3D1	O14617	1153 aa		15.83	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	SURF4	O15260	269 aa		15.83	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	15.83	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	OR5F1	O95221	314 aa		15.83	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	IL7	P13232	177 aa		15.83	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	FGF9	P31371	208 aa	Predicted RBP	15.83	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	15.83	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	TNFRSF4	P43489	277 aa		15.83	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	RFX2	P48378	723 aa		15.83	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	TNFRSF17	Q02223	184 aa		15.83	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	RGS1	Q08116	209 aa		15.83	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	HSDL2	Q6YN16	418 aa		15.83	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		15.83	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	GDF7	Q7Z4P5	450 aa		15.83	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	ASPG	Q86U10	573 aa		15.83	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	UFD1	Q92890	307 aa		15.83	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	MCHR1	Q99705	422 aa		15.83	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	CERS4	Q9HA82	394 aa		15.83	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	ABCB9	Q9NP78	766 aa		15.83	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	15.83	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		15.83	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	HTR3E	A5X5Y0	456 aa		15.82	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	SLC30A4	O14863	429 aa		15.82	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	SLC31A1	O15431	190 aa		15.82	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	AGR2	O95994	175 aa		15.82	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	EIF2S1	P05198	315 aa	Known RBP	15.82	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	NDUFS1	P28331	727 aa		15.82	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	GABRA5	P31644	462 aa		15.82	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	SDC2	P34741	201 aa		15.82	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	CD79B	P40259	229 aa		15.82	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	CDH11	P55287	796 aa		15.82	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	GPR50	Q13585	617 aa		15.82	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM44	Q2T9K0	475 aa		15.82	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	15.82	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	SLC30A6	Q6NXT4	461 aa		15.82	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	MBOAT2	Q6ZWT7	520 aa		15.82	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	SHF	Q7M4L6	423 aa		15.82	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		15.82	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	UBQLNL	Q8IYU4	475 aa		15.82	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	FLVCR1-AS1	Q8TAF5	88 aa		15.82	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	CDS1	Q92903	461 aa		15.82	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	RFK	Q969G6	155 aa		15.82	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		15.82	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	SLC41A3	Q96GZ6	507 aa		15.82	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	15.82	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	MED17	Q9NVC6	651 aa		15.82	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	TBC1D3D	A0A087WVF3	549 aa		15.82	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	TBC1D3I	A0A087WXS9	549 aa		15.82	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	TBC1D3E	A0A087X179	549 aa		15.82	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	TBC1D3K	A0A087X1G2	549 aa		15.82	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	TBC1D3F	A6NER0	549 aa	Predicted RBP	15.82	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	TBC1D3L	B9A6J9	549 aa		15.82	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	LRRTM2	O43300	516 aa		15.82	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	TBC1D3H	P0C7X1	549 aa		15.82	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	SLC1A3	P43003	542 aa		15.82	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	OR2B6	P58173	313 aa		15.82	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	15.82	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	TBC1D3G	Q6DHY5	549 aa		15.82	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	TBC1D3C	Q6IPX1	549 aa		15.82	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	FBXO42	Q6P3S6	717 aa		15.82	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		15.82	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	C11orf74	Q86VG3	221 aa		15.82	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	TBC1D3	Q8IZP1	549 aa	Predicted RBP	15.82	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	OR2L13	Q8N349	312 aa		15.82	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		15.82	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	TM4SF19	Q96DZ7	209 aa		15.82	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	TM9SF2	Q99805	663 aa		15.82	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	CTRC	Q99895	268 aa		15.82	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		15.82	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF624	Q9P2J8	865 aa	Predicted RBP	15.82	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	15.81	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	HOXC4	P09017	264 aa	Predicted RBP	15.81	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	SMIM10L1	P0DMW3	83 aa		15.81	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	GPR4	P46093	362 aa		15.81	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	KIAA1024L	P59773	190 aa		15.81	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	PPP2CB	P62714	309 aa		15.81	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	PPP2CA	P67775	309 aa		15.81	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	FABP5	Q01469	135 aa		15.81	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	PGGHG	Q32M88	737 aa		15.81	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	ARHGAP11B	Q3KRB8	267 aa		15.81	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	CRTC2	Q53ET0	693 aa	Predicted RBP	15.81	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	TYW3	Q6IPR3	259 aa	Known RBP	15.81	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	XKRX	Q6PP77	449 aa		15.81	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	NRM	Q8IXM6	262 aa		15.81	■□□□□ 0.12
TOM1-210	ENST00000449058	SAMD14	Q8IZD0	417 aa	Predicted RBP	15.81	■□□□□ 0.12

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