RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447733.5

TOM1-209, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TOM1, Length 2,317 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-209ENST00000447733 IFT52Q9Y366 437 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-209ENST00000447733 SCN2AQ99250 2005 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-209ENST00000447733 M0R082 166 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-209ENST00000447733 STK25O00506 426 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-209ENST00000447733 CHST10O43529 356 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-209ENST00000447733 GABRB1P18505 474 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-209ENST00000447733 BCKDHBP21953 392 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-209ENST00000447733 ZP2Q05996 745 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-209ENST00000447733 C14orf28Q4W4Y0 310 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-209ENST00000447733 CDRT4Q8N9R6 151 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-209ENST00000447733 DNASE2BQ8WZ79 361 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-209ENST00000447733 MYDGFQ969H8 173 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-209ENST00000447733 ZNF285Q96NJ3 590 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-209ENST00000447733 DCSTAMPQ9H295 470 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-209ENST00000447733 DSN1Q9H410 356 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-209ENST00000447733 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TOM1-209ENST00000447733 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TOM1-209ENST00000447733 ADAP2Q9NPF8 381 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-209ENST00000447733 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-209ENST00000447733 KLHL28Q9NXS3 571 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-209ENST00000447733 ZNF226Q9NYT6 803 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-209ENST00000447733 REV1Q9UBZ9 1251 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-209ENST00000447733 WDR45Q9Y484 360 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-209ENST00000447733 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-209ENST00000447733 TLCD2A6NGC4 264 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-209ENST00000447733 FCMRO60667 390 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-209ENST00000447733 CDK1P06493 297 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-209ENST00000447733 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TOM1-209ENST00000447733 CXCL12P48061 93 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-209ENST00000447733 EPHA4P54764 986 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-209ENST00000447733 TUBA1BP68363 451 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-209ENST00000447733 MGAT2Q10469 447 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-209ENST00000447733 SYT16Q17RD7 645 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-209ENST00000447733 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TOM1-209ENST00000447733 PODNL1Q6PEZ8 512 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-209ENST00000447733 TUBA1AQ71U36 451 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-209ENST00000447733 Q7L0L9 218 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-209ENST00000447733 CCDC103Q8IW40 242 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-209ENST00000447733 ZG16BQ96DA0 208 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-209ENST00000447733 STACQ99469 402 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-209ENST00000447733 RAB33BQ9H082 229 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-209ENST00000447733 DUSP22Q9NRW4 184 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-209ENST00000447733 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TOM1-209ENST00000447733 SATB2Q9UPW6 733 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-209ENST00000447733 BLACEA4D250 179 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-209ENST00000447733 CLCA1A8K7I4 914 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-209ENST00000447733 K7ESF4 209 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-209ENST00000447733 MPZL2O60487 215 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-209ENST00000447733 SDC3O75056 442 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-209ENST00000447733 PIAS2O75928 621 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-209ENST00000447733 SLC35E2P0CK97 266 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-209ENST00000447733 RNH1P13489 461 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TOM1-209ENST00000447733 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TOM1-209ENST00000447733 CTSKP43235 329 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-209ENST00000447733 GABRA4P48169 554 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-209ENST00000447733 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TOM1-209ENST00000447733 ILKQ13418 452 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-209ENST00000447733 INAVAQ3KP66 663 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-209ENST00000447733 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-209ENST00000447733 PEX5LQ8IYB4 626 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-209ENST00000447733 MCFD2Q8NI22 146 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-209ENST00000447733 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-209ENST00000447733 GGHQ92820 318 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-209ENST00000447733 CTHRC1Q96CG8 243 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-209ENST00000447733 DACH2Q96NX9 599 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-209ENST00000447733 MKLN1Q9UL63 735 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-209ENST00000447733 PLCL2Q9UPR0 1127 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-209ENST00000447733 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TOM1-209ENST00000447733 CHST2Q9Y4C5 530 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-209ENST00000447733 TRIOO75962 3097 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-209ENST00000447733 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TOM1-209ENST00000447733 I3L1I5 382 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TOM1-209ENST00000447733 AIREO43918 545 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-209ENST00000447733 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TOM1-209ENST00000447733 CLK1P49759 484 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TOM1-209ENST00000447733 PPP5CP53041 499 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-209ENST00000447733 FAM53BQ14153 422 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-209ENST00000447733 TIGD6Q17RP2 521 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-209ENST00000447733 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-209ENST00000447733 TGM7Q96PF1 710 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-209ENST00000447733 SDF2Q99470 211 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-209ENST00000447733 ZNF350Q9GZX5 532 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-209ENST00000447733 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-209ENST00000447733 INIPQ9NRY2 104 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-209ENST00000447733 UCKL1Q9NWZ5 548 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-209ENST00000447733 EPHA6Q9UF33 1036 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-209ENST00000447733 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.072e-7■■■■■ 54.4
TOM1-209ENST00000447733 TMEM221A6NGB7 291 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-209ENST00000447733 FOXS1O43638 330 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-209ENST00000447733 MED26O95402 600 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-209ENST00000447733 NSA2O95478 260 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TOM1-209ENST00000447733 CT62P0C5K7 136 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-209ENST00000447733 CD40LGP29965 261 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-209ENST00000447733 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TOM1-209ENST00000447733 GFERP55789 205 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-209ENST00000447733 TAS2R41P59536 307 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-209ENST00000447733 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
TOM1-209ENST00000447733 GARNL3Q5VVW2 1013 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-209ENST00000447733 CD300LDQ6UXZ3 194 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-209ENST00000447733 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.1 ms