RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 A8MUI8 341 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 SUPT3HB4E1H0 165 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 E2F3O00716 465 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNHIT1O43257 154 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 B4GALT2O60909 372 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 DNAJB6O75190 326 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 SUPT3HO75486 399 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 BMP10O95393 424 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 NSA2O95478 260 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 ENO1P06733 434 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRR35P0CG20 571 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 HIST1H2ADP20671 130 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAOAP21397 527 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRPH2P23942 346 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 CASQ1P31415 396 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 HSD17B2P37059 387 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC26A3P40879 764 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 SOX2P48431 317 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCR8P51685 355 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 PLTPP55058 493 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 AP1S2P56377 157 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 KCNK10P57789 538 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 ABATP80404 500 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 RGS1Q08116 209 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 MFAP5Q13361 173 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR4D1Q15615 310 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRADDQ15628 312 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 SFT2D3Q587I9 215 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 FHL5Q5TD97 284 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM219BQ5XKK7 198 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 C8orf74Q6P047 294 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 MTFR2Q6P444 385 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 ISLR2Q6UXK2 745 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 BEST3Q8N1M1 668 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 KIF2BQ8N4N8 673 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 CAMKVQ8NCB2 501 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 CATSPER1Q8NEC5 780 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPATA4Q8NEY3 305 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR51Q1Q8NH59 317 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 FBXO25Q8TCJ0 367 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 GRHL3Q8TE85 626 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 PPP4R1Q8TF05 950 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 PYROXD1Q8WU10 500 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC13A3Q8WWT9 602 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 METTL21AQ8WXB1 218 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 ESAMQ96AP7 390 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 FBXL8Q96CD0 374 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF347Q96SE7 839 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 CSF3RQ99062 836 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 RBBP8Q99708 897 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM79Q9BSE2 394 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 HAUS8Q9BT25 410 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 H2AFJQ9BTM1 129 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 TM2D2Q9BX73 214 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 HES7Q9BYE0 225 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 RHOJQ9H4E5 214 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 KLHL31Q9H511 634 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 KLHL1Q9NR64 748 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 GRHL1Q9NZI5 618 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 TXNDC16Q9P2K2 825 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 CDC14AQ9UNH5 594 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC22A14Q9Y267 594 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 NOTCH2Q04721 2471 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 MYO9AB2RTY4 2548 aa4.12□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRBC2A0A5B9 178 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARHGAP10A1A4S6 786 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 DYTNA2CJ06 578 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 CLEC18AA5D8T8 446 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 WIPF3A6NGB9 483 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 SAC3D1A6NKF1 404 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 LINC01548A6NM66 108 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 E7ESA3 106 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 UBXN8O00124 270 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 SAP18O00422 153 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 NDC80O14777 642 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 ERI3O43414 337 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 ACSL3O95573 720 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 WDPCPO95876 746 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGHEP01854 428 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 FHP07954 510 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 CD63P08962 238 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC166P0CW27 439 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 PCNAP12004 261 aa4.11□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms