RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	KRT20	P35900	424 aa		16.1	■□□□□ 0.17
MRPL28-203	ENST00000429738	ASCL1	P50553	236 aa		16.1	■□□□□ 0.17
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM107	Q6UX40	140 aa		16.1	■□□□□ 0.17
MRPL28-203	ENST00000429738	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		16.1	■□□□□ 0.17
MRPL28-203	ENST00000429738	CDC20B	Q86Y33	519 aa		16.1	■□□□□ 0.17
MRPL28-203	ENST00000429738	OR2T11	Q8NH01	316 aa		16.1	■□□□□ 0.17
MRPL28-203	ENST00000429738	EFHD2	Q96C19	240 aa	Predicted RBP	16.1	■□□□□ 0.17
MRPL28-203	ENST00000429738	ELP4	Q96EB1	424 aa		16.1	■□□□□ 0.17
MRPL28-203	ENST00000429738	UCN2	Q96RP3	112 aa		16.1	■□□□□ 0.17
MRPL28-203	ENST00000429738	TRIB1	Q96RU8	372 aa		16.1	■□□□□ 0.17
MRPL28-203	ENST00000429738	TRMO	Q9BU70	441 aa		16.1	■□□□□ 0.17
MRPL28-203	ENST00000429738	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		16.1	■□□□□ 0.17
MRPL28-203	ENST00000429738		A6NNC1	897 aa		16.09	■□□□□ 0.17
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC28A1	O00337	649 aa		16.09	■□□□□ 0.17
MRPL28-203	ENST00000429738	AZIN1	O14977	448 aa		16.09	■□□□□ 0.17
MRPL28-203	ENST00000429738	TRIM13	O60858	407 aa		16.09	■□□□□ 0.17
MRPL28-203	ENST00000429738	SEC22B	O75396	215 aa		16.09	■□□□□ 0.17
MRPL28-203	ENST00000429738	NTS	P30990	170 aa		16.09	■□□□□ 0.17
MRPL28-203	ENST00000429738	MRPS22	P82650	360 aa	Known RBP	16.09	■□□□□ 0.17
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	16.09	■□□□□ 0.17
MRPL28-203	ENST00000429738	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		16.09	■□□□□ 0.17
MRPL28-203	ENST00000429738	TRABD2A	Q86V40	505 aa		16.09	■□□□□ 0.17
MRPL28-203	ENST00000429738	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		16.09	■□□□□ 0.17
MRPL28-203	ENST00000429738	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	16.09	■□□□□ 0.17
MRPL28-203	ENST00000429738	BANP	Q8N9N5	519 aa		16.09	■□□□□ 0.17
MRPL28-203	ENST00000429738	OR2W6P	Q8NHA6	318 aa		16.09	■□□□□ 0.17
MRPL28-203	ENST00000429738	OR14L1P	Q8NHC6	308 aa		16.09	■□□□□ 0.17
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM222B	Q8WU58	562 aa		16.09	■□□□□ 0.17
MRPL28-203	ENST00000429738	APOPT1	Q96IL0	206 aa		16.09	■□□□□ 0.17
MRPL28-203	ENST00000429738	LMF2	Q9BU23	707 aa	Known RBP	16.09	■□□□□ 0.17
MRPL28-203	ENST00000429738	G6PC3	Q9BUM1	346 aa		16.09	■□□□□ 0.17
MRPL28-203	ENST00000429738	LRTM1	Q9HBL6	345 aa		16.09	■□□□□ 0.17
MRPL28-203	ENST00000429738	C1orf109	Q9NX04	203 aa		16.09	■□□□□ 0.17
MRPL28-203	ENST00000429738	JMJD1C	Q15652	2540 aa		16.09	■□□□□ 0.17
MRPL28-203	ENST00000429738	RGS14	O43566	566 aa		16.08	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	ZIC3	O60481	467 aa		16.08	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	TBX19	O60806	448 aa		16.08	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	NEFH	P12036	1026 aa		16.08	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	CYP4B1	P13584	511 aa		16.08	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	GRK2	P25098	689 aa		16.08	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	UQCRC1	P31930	480 aa		16.08	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	EVI2B	P34910	448 aa		16.08	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	GCK	P35557	465 aa		16.08	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	LHX2	P50458	406 aa		16.08	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	GAB1	Q13480	694 aa		16.08	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	RCAN2	Q14206	197 aa		16.08	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	KANK2	Q63ZY3	851 aa		16.08	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	OR5M10	Q6IEU7	315 aa		16.08	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	ENPP6	Q6UWR7	440 aa		16.08	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	BIVM	Q86UB2	503 aa		16.08	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	IFNE	Q86WN2	208 aa		16.08	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	FADS6	Q8N9I5	356 aa		16.08	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		16.08	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	16.08	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	16.08	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	CCT7	Q99832	543 aa		16.08	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	TUBA1C	Q9BQE3	449 aa		16.08	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	DDX18	Q9NVP1	670 aa	Known RBP	16.08	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	TAS2R10	Q9NYW0	307 aa		16.08	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	JKAMP	Q9P055	326 aa		16.08	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	CBLC	Q9ULV8	474 aa		16.08	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	OR10H1	Q9Y4A9	318 aa		16.08	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	DNAJC15	Q9Y5T4	150 aa		16.08	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	16.07	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	C17orf51	A8MQB3	221 aa		16.07	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	LSM1	O15116	133 aa	Known RBP	16.07	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	FADS1	O60427	444 aa		16.07	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	IL18BP	O95998	194 aa		16.07	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	FGF4	P08620	206 aa		16.07	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	SDC1	P18827	310 aa		16.07	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	CTSS	P25774	331 aa		16.07	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	MAP3K8	P41279	467 aa		16.07	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	FRK	P42685	505 aa	Predicted RBP	16.07	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	VSNL1	P62760	191 aa		16.07	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	LTB	Q06643	244 aa		16.07	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	16.07	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	UGT3A2	Q3SY77	523 aa		16.07	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		16.07	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF385B	Q569K4	471 aa		16.07	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		16.07	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		16.07	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	LRRC46	Q96FV0	321 aa		16.07	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	LGALS13	Q9UHV8	139 aa		16.07	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	16.07	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	ABCG2	Q9UNQ0	655 aa		16.07	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	TLDC2	A0PJX2	215 aa		16.06	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	PDPK1	O15530	556 aa		16.06	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	NPHS1	O60500	1241 aa		16.06	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	IL33	O95760	270 aa		16.06	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	CHRNG	P07510	517 aa		16.06	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF708	P17019	499 aa		16.06	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	CHM	P24386	653 aa		16.06	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	ALDH3A1	P30838	453 aa		16.06	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	OPRM1	P35372	400 aa		16.06	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	STAR	P49675	285 aa		16.06	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	DSCR4	P56555	118 aa	Predicted RBP	16.06	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	CLDN18	P56856	261 aa		16.06	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	B3GALT5-AS1	P59052	145 aa		16.06	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	PDE7A	Q13946	482 aa		16.06	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	RFTN2	Q52LD8	501 aa	Predicted RBP	16.06	■□□□□ 0.16

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