RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 STX3Q13277 289 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 VEZF1Q14119 521 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 MLC1Q15049 377 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
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PTPRK-211ENST00000429595 REG4Q9BYZ8 158 aa5.69□□□□□ -1.5
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PTPRK-211ENST00000429595 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP5.69□□□□□ -1.53e-6■■■■■ 36.9
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PTPRK-211ENST00000429595 MAU2Q9Y6X3 613 aa5.69□□□□□ -1.5
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PTPRK-211ENST00000429595 BTN3A1O00481 513 aa5.68□□□□□ -1.5
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PTPRK-211ENST00000429595 BCKDKO14874 412 aa5.68□□□□□ -1.5
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PTPRK-211ENST00000429595 SLC25A12O75746 678 aa5.68□□□□□ -1.5
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PTPRK-211ENST00000429595 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
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PTPRK-211ENST00000429595 MARC1Q5VT66 337 aa5.68□□□□□ -1.5
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PTPRK-211ENST00000429595 NPNTQ6UXI9 565 aa5.68□□□□□ -1.5
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PTPRK-211ENST00000429595 AMIGO1Q86WK6 493 aa5.68□□□□□ -1.5
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PTPRK-211ENST00000429595 SMIM14Q96QK8 99 aa5.68□□□□□ -1.5
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PTPRK-211ENST00000429595 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP5.68□□□□□ -1.5
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PTPRK-211ENST00000429595 HEY1Q9Y5J3 304 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 SPTBP11277 2137 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 A0A0G2JND7 137 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 CCDC189A1A4V9 331 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 FAM170AA1A519 330 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 GOLGA8OA6NCC3 632 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 GABRR3A8MPY1 467 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 GOLGA8NF8WBI6 632 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 H3BMH7 237 aa5.67□□□□□ -1.5
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