RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 IL20RAQ9UHF4 553 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 ATG4BQ9Y4P1 393 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 WDFY4Q6ZS81 3184 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 IGLON5A6NGN9 336 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 GUCY1B2O75343 617 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 TRAPPC2P0DI81 140 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 TRAPPC2BP0DI82 140 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 PTNP21246 168 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 IGFBP4P22692 258 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 CDH11P55287 796 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 QPRTQ15274 297 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 P2RY14Q15391 338 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 LCN1P1Q5VSP4 162 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 PAMR1Q6UXH9 720 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 PRR23CQ6ZRP0 262 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 NOXA1Q86UR1 476 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 C12orf66Q96MD2 445 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 PINK1Q9BXM7 581 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC13A4Q9UKG4 626 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 NTNG1Q9Y2I2 539 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A0G2JPF8 293 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A1W2PP55 124 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A1W2PR48 441 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 CLEC3AO75596 197 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 PCDH8O95206 1070 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 GNSP15586 552 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC1A3P43003 542 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 AVPR1BP47901 424 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 CHRNEQ04844 493 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 Q8N402 240 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 RNF170Q96K19 258 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 PRRG3Q9BZD7 231 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 OR1A2Q9Y585 309 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 FRYLO94915 3013 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 IRGMA1A4Y4 181 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 CASC3O15234 703 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 SEC14L5O43304 696 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 CELP19835 753 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 BCL6P41182 706 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 TSPAN31Q12999 210 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 RAB30Q15771 203 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 TRIQKQ629K1 86 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 C18orf63Q68DL7 685 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 C19orf18Q8NEA5 215 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 STON1Q9Y6Q2 735 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 PSKH1P11801 424 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 ACP5P13686 325 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP17.49■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 PPP3R1P63098 170 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP17.49■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP17.49■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 DZANK1Q9NVP4 752 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP17.49■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP17.49■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 ALPPP05187 535 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 TRIM23P36406 574 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 IFNGR2P38484 337 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 IL18Q14116 193 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 GNA13Q14344 377 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP17.49■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 PLET1Q6UQ28 207 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF438Q7Z4V0 828 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 MARCH9Q86YJ5 346 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 NKAIN4Q8IVV8 208 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 OR2A1Q8NGT9 310 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 GANCQ8TET4 914 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP17.49■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 OR7D2Q96RA2 312 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 SHISA3A0PJX4 238 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 YES1P07947 543 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP17.48■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 GPR4P46093 362 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 MAP2K3P46734 347 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 TRAM2Q15035 370 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 WSCD2Q2TBF2 565 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 Q5BKY6 102 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 BHLHB9Q6PI77 547 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 ACOT4Q8N9L9 421 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 BBS1Q8NFJ9 593 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 OR4Q3Q8NH05 313 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC38A1Q9H2H9 487 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 ISYNA1Q9NPH2 558 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 ENTPD4Q9Y227 616 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 DMDP11532 3685 aa17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms