RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409093.1

LRRTM4-202, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene LRRTM4, Length 2,247 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-202ENST00000409093 IL18R1Q13478 541 aa9.36□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP9.36□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 GANABQ14697 944 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa9.36□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 GPAT3Q53EU6 434 aa9.36□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF691Q5VV52 312 aa9.36□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 FAM92BQ6ZTR7 304 aa9.36□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 LGI4Q8N135 537 aa9.36□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 GPR32P1Q8NGA4 272 aa9.36□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 OR10G2Q8NGC3 310 aa9.36□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 BBS10Q8TAM1 723 aa9.36□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 TEX47Q8TBZ9 253 aa9.36□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 CCDC120Q96HB5 630 aa9.36□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 MAP3K3Q99759 626 aa9.36□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 MROQ9BYG7 248 aa9.36□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 UCK1Q9HA47 277 aa9.36□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 PRDM9Q9NQV7 894 aa9.36□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa9.36□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF98A6NK75 572 aa9.36□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 SGK494L7N484 410 aa9.36□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 LDB3O75112 727 aa9.36□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 SCO1O75880 301 aa9.36□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 GADD45GO95257 159 aa9.36□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 CPMP14384 443 aa9.36□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 KCNJ5P48544 419 aa9.36□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 COPZ1P61923 177 aa9.36□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 FUT5Q11128 374 aa9.36□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 MEP1AQ16819 746 aa9.36□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 TBRG1Q3YBR2 411 aa9.36□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 C16orf54Q6UWD8 224 aa9.36□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 USP53Q70EK8 1073 aa9.36□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 OLIG3Q7RTU3 272 aa9.36□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 TAGAPQ8N103 731 aa9.36□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 SETD9Q8NE22 299 aa9.36□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 OR7G2Q8NG99 324 aa9.36□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 OR4C15Q8NGM1 316 aa9.36□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 OR5H6Q8NGV6 325 aa9.36□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 TRIM63Q969Q1 353 aa9.36□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF354BQ96LW1 612 aa9.36□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 MS4A4EQ96PG1 132 aa9.36□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 OR7D2Q96RA2 312 aa9.36□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa9.36□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 ANKHQ9HCJ1 492 aa9.36□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 COQ3Q9NZJ6 369 aa9.36□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF175Q9Y473 711 aa9.36□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 GMPPBQ9Y5P6 360 aa9.36□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 MAU2Q9Y6X3 613 aa9.36□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 A0A1W2PQ72 361 aa9.35□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 PRSS44E7EML9 344 aa9.35□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa9.35□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 TOR1AO14656 332 aa9.35□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 B4GAT1O43505 415 aa9.35□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 ASNA1O43681 348 aa9.35□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 RDH16O75452 317 aa9.35□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 PIAS2O75928 621 aa9.35□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 ECDO95905 644 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 CTSBP07858 339 aa9.35□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 CHRM4P08173 479 aa9.35□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 APEHP13798 732 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 HLCSP50747 726 aa9.35□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 ISL1P61371 349 aa9.35□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 IL5RAQ01344 420 aa9.35□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 CD47Q08722 323 aa9.35□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 DMWDQ09019 674 aa9.35□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 RAPSNQ13702 412 aa9.35□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 KEAP1Q14145 624 aa9.35□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 MICAQ29983 383 aa9.35□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 C14orf28Q4W4Y0 310 aa9.35□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 FAM111BQ6SJ93 734 aa9.35□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 DEF8Q6ZN54 512 aa9.35□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF605Q86T29 641 aa9.35□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 CA13Q8N1Q1 262 aa9.35□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 SLC5A8Q8N695 610 aa9.35□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 SLC15A4Q8N697 577 aa9.35□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 DNASE2BQ8WZ79 361 aa9.35□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 TCTN2Q96GX1 697 aa9.35□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 PCDH15Q96QU1 1955 aa9.35□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 FEVQ99581 238 aa9.35□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 ACTRT3Q9BYD9 372 aa9.35□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 BCL2L10Q9HD36 194 aa9.35□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 ACER3Q9NUN7 267 aa9.35□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa9.35□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 RHCGQ9UBD6 479 aa9.35□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa9.35□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 KCNE3Q9Y6H6 103 aa9.35□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa9.35□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 TRAV20A0A0B4J274 112 aa9.35□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 A0A0G2JPF8 293 aa9.35□□□□□ -0.91
LRRTM4-202ENST00000409093 RAB19A4D1S5 217 aa9.35□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.3 ms