RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392415.6

UBE2E3-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,347 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-201ENST00000392415 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 BMP7P18075 431 aa18.74■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 GRK2P25098 689 aa18.74■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 ADH7P40394 386 aa18.74■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 IL23RQ5VWK5 629 aa18.74■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 PM20D2Q8IYS1 436 aa18.74■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF781Q8N8C0 355 aa18.74■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 TUBGCP3Q96CW5 907 aa18.74■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 GIMAP5Q96F15 307 aa18.74■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 SPOCK3Q9BQ16 436 aa18.74■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 C1orf50Q9BV19 199 aa18.74■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 UCK2Q9BZX2 261 aa18.74■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 OR2B2Q9GZK3 357 aa18.74■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 C20orf27Q9GZN8 174 aa18.74■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 C3orf14Q9HBI5 128 aa18.74■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 Q9UFV3 132 aa18.74■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa18.74■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 FADS1O60427 444 aa18.74■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 IL33O95760 270 aa18.74■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 ACTL6AO96019 429 aa18.74■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 GABRA3P34903 492 aa18.74■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 EVI2BP34910 448 aa18.74■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 TFF3Q07654 80 aa18.74■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa18.74■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 NUP43Q8NFH3 380 aa18.74■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 OR7A2PQ8NGA2 310 aa18.74■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 WDYHV1Q96HA8 205 aa18.74■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 KCNJ16Q9NPI9 418 aa18.74■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 EQTNQ9NQ60 294 aa18.74■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 ABCG2Q9UNQ0 655 aa18.74■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 RAP2CQ9Y3L5 183 aa18.74■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 CREBBPQ92793 2442 aa18.73■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 PCNX3Q9H6A9 2034 aa18.73■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM90A27PA6NNH2 459 aa18.73■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 B4DXG7 233 aa18.73■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 EMC8O43402 210 aa18.73■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 ERLIN1O75477 346 aa18.73■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 TOXO94900 526 aa18.73■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 NKX2-2O95096 273 aa18.73■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 EPPINO95925 133 aa18.73■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 LAMP1P11279 417 aa18.73■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 BGNP21810 368 aa18.73■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 SRD5A2P31213 254 aa18.73■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC1A6P48664 564 aa18.73■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 EMX2Q04743 252 aa18.73■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 SMU1Q2TAY7 513 aa18.73■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 VPS26BQ4G0F5 336 aa18.73■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 DCST1Q5T197 706 aa18.73■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 SEM1Q6ZVN7 128 aa18.73■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 RIMKLAQ8IXN7 391 aa18.73■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 NATD1Q8N6N6 113 aa18.73■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 CDRT4Q8N9R6 151 aa18.73■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 DTNBP1Q96EV8 351 aa18.73■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 SORT1Q99523 831 aa18.73■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 HAO1Q9UJM8 370 aa18.73■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 FBXL2Q9UKC9 423 aa18.73■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 CSMD2Q7Z408 3487 aa18.72■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 NKX2-6A6NCS4 301 aa18.72■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 KCNH1O95259 989 aa18.72■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 PRPS1L1P21108 318 aa18.72■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 GCKP35557 465 aa18.72■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 RPL14P50914 215 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 PRKAG1P54619 331 aa18.72■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP18.72■□□□□ 0.599e-6■■□□□ 14.4
UBE2E3-201ENST00000392415 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 CPTPQ5TA50 214 aa18.72■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 OR5M10Q6IEU7 315 aa18.72■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa18.72■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 KIRREL3Q8IZU9 778 aa18.72■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa18.72■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 OR14L1PQ8NHC6 308 aa18.72■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 GPR151Q8TDV0 419 aa18.72■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 PIK3R3Q92569 461 aa18.72■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 COQ8BQ96D53 544 aa18.72■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 MS4A4EQ96PG1 132 aa18.72■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 ASIC5Q9NY37 505 aa18.72■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 FLRT3Q9NZU0 649 aa18.72■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 CAMK2AQ9UQM7 478 aa18.72■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 A0A1W2PRB8 838 aa18.71■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 GXYLT2A0PJZ3 443 aa18.71■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 G6PDP11413 515 aa18.71■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 IGFBP2P18065 325 aa18.71■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 GFRA1P56159 465 aa18.71■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 C21orf58P58505 322 aa18.71■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 PRR5P85299 388 aa18.71■□□□□ 0.59
UBE2E3-201ENST00000392415 STX3Q13277 289 aa18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms