RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334268.8

TRDN-201, Transcript of triadin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 4,770 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-201ENST00000334268 SOCS6O14544 535 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 FAM155BO75949 473 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 SEC14L2O76054 403 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 ACPPP15309 386 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 DTYMKP23919 212 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 TNFRSF8P28908 595 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 HOXA6P31267 233 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 FOXN2P32314 431 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 VHLP40337 213 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 PREPP48147 710 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 NPY2RP49146 381 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 MAN2A2P49641 1150 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 CLDN2P57739 230 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 UBE2G2P60604 165 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 B2MP61769 119 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 PDK3Q15120 406 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 GSTA3Q16772 222 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 KIF19Q2TAC6 998 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 ZNF284Q2VY69 593 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 USP30Q70CQ3 517 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 GLB1L2Q8IW92 636 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 OR2L8Q8NGY9 312 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 NFKBIDQ8NI38 313 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 APH1AQ96BI3 265 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 RHBDF1Q96CC6 855 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 CMTM5Q96DZ9 223 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 BMFQ96LC9 184 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 COQ10AQ96MF6 247 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 BTBD9Q96Q07 612 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 CGREF1Q99674 301 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 ATG10Q9H0Y0 220 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 FN3KQ9H479 309 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 PHF11Q9UIL8 331 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 CDYLQ9Y232 598 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 MSRB2Q9Y3D2 182 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 ST14Q9Y5Y6 855 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 ACACBO00763 2458 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 SLC22A2O15244 555 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 ST8SIA3O43173 380 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 PCDHGA12O60330 932 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 GATBO75879 557 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 SOX30O94993 753 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 SERPINA1P01009 418 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 GBAP04062 536 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 TSPAN8P19075 237 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 DCKP27707 260 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 IL12BP29460 328 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 CAV1Q03135 178 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 BIKQ13323 160 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 PON3Q15166 354 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 NEDD8Q15843 81 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 DUOXA1Q1HG43 343 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 LCE2CQ5TA81 110 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 DPPA4Q7L190 304 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 HCAR2Q8TDS4 363 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 MEGF10Q96KG7 1140 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 APOLD1Q96LR9 279 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 CNBD2Q96M20 576 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 RNF145Q96MT1 663 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 DDOQ99489 341 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 MICU1Q9BPX6 476 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 SLC17A9Q9BYT1 436 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 SRRQ9GZT4 340 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 RACGAP1Q9H0H5 632 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 CTPS2Q9NRF8 586 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 TMEM74BQ9NUR3 256 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 C1orf123Q9NWV4 160 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 FZD4Q9ULV1 537 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 OR1A2Q9Y585 309 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 U3KQV3 271 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 A0A1W2PQ67 120 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 TMEM202A6NGA9 273 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 TGFBR3LH3BV60 316 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 ERVH48-1M5A8F1 160 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 TNFRSF10AO00220 468 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 ADAM10O14672 748 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 TO15178 435 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-201ENST00000334268 OIP5O43482 229 aa2.95□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms