RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323076.6

LCP1-201, Transcript of lymphocyte cytosolic protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LCP1, Length 3,787 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP1-201ENST00000323076 HAPLN2Q9GZV7 340 aa6.6□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa6.6□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 CBY3A6NI87 242 aa6.59□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 HPRP00739 348 aa6.59□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 SERPINA3P01011 423 aa6.59□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 IFNA6P05013 189 aa6.59□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 ALPIP09923 528 aa6.59□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 PTPN3P26045 913 aa6.59□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 ZP1P60852 638 aa6.59□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 MELKQ14680 651 aa6.59□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 PEA15Q15121 130 aa6.59□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 CCDC157Q569K6 752 aa6.59□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 DNLZQ5SXM8 178 aa6.59□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 C10orf91Q5T1B1 145 aa6.59□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 HACD4Q5VWC8 232 aa6.59□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 RNLSQ5VYX0 342 aa6.59□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 MFSD14CQ5VZR4 134 aa6.59□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 FBXO42Q6P3S6 717 aa6.59□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 NPAS3Q8IXF0 933 aa6.59□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 OR5D18Q8NGL1 313 aa6.59□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa6.59□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 SLC35C1Q96A29 364 aa6.59□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 SLC25A28Q96A46 364 aa6.59□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 MVB12AQ96EY5 273 aa6.59□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa6.59□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa6.59□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa6.59□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 TPRKBQ9Y3C4 175 aa6.59□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 SUV39H1O43463 412 aa6.59□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 OR2T1O43869 369 aa6.59□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 NCR1O76036 304 aa6.59□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 SPDEFO95238 335 aa6.59□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 GJA4P35212 333 aa6.59□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 JAK3P52333 1124 aa6.59□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 TSTQ16762 297 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa6.59□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 OR4C15Q8NGM1 316 aa6.59□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 NUBPLQ8TB37 319 aa6.59□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 CHTF18Q8WVB6 975 aa6.59□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa6.59□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 ACOT12Q8WYK0 555 aa6.59□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 C3orf49Q96BT1 292 aa6.59□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 FAHD2AQ96GK7 314 aa6.59□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 TCTN2Q96GX1 697 aa6.59□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 ZNF382Q96SR6 550 aa6.59□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 SEPHS2Q99611 448 aa6.59□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 PARPBPQ9NWS1 579 aa6.59□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 IL19Q9UHD0 177 aa6.59□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 COQ4Q9Y3A0 265 aa6.59□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 REV3LO60673 3130 aa6.59□□□□□ -1.35
LCP1-201ENST00000323076 A0A096LPI6 279 aa6.59□□□□□ -1.36
LCP1-201ENST00000323076 FABP12A6NFH5 140 aa6.59□□□□□ -1.36
LCP1-201ENST00000323076 GPR89AB7ZAQ6 455 aa6.59□□□□□ -1.36
LCP1-201ENST00000323076 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.36
LCP1-201ENST00000323076 HOXB5P09067 269 aa6.59□□□□□ -1.36
LCP1-201ENST00000323076 GPR89BP0CG08 455 aa6.59□□□□□ -1.36
LCP1-201ENST00000323076 NCK1P16333 377 aa6.59□□□□□ -1.36
LCP1-201ENST00000323076 HOXA5P20719 270 aa6.59□□□□□ -1.36
LCP1-201ENST00000323076 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.36
LCP1-201ENST00000323076 RAB5CP51148 216 aa6.59□□□□□ -1.36
LCP1-201ENST00000323076 PWP1Q13610 501 aa6.59□□□□□ -1.36
LCP1-201ENST00000323076 GXYLT1Q4G148 440 aa6.59□□□□□ -1.36
LCP1-201ENST00000323076 CD276Q5ZPR3 534 aa6.59□□□□□ -1.36
LCP1-201ENST00000323076 SHISA2Q6UWI4 295 aa6.59□□□□□ -1.36
LCP1-201ENST00000323076 PTCHD4Q6ZW05 846 aa6.59□□□□□ -1.36
LCP1-201ENST00000323076 C1orf186Q6ZWK4 172 aa6.59□□□□□ -1.36
LCP1-201ENST00000323076 ZNF605Q86T29 641 aa6.59□□□□□ -1.36
LCP1-201ENST00000323076 ZNF614Q8N883 585 aa6.59□□□□□ -1.36
LCP1-201ENST00000323076 FAM46DQ8NEK8 389 aa6.59□□□□□ -1.36
LCP1-201ENST00000323076 OR2T35Q8NGX2 323 aa6.59□□□□□ -1.36
LCP1-201ENST00000323076 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa6.59□□□□□ -1.36
LCP1-201ENST00000323076 SLC39A7Q92504 469 aa6.59□□□□□ -1.36
LCP1-201ENST00000323076 OSTF1Q92882 214 aa6.59□□□□□ -1.36
LCP1-201ENST00000323076 CPNE1Q99829 537 aa6.59□□□□□ -1.36
LCP1-201ENST00000323076 MGME1Q9BQP7 344 aa6.59□□□□□ -1.36
LCP1-201ENST00000323076 DDA1Q9BW61 102 aa6.59□□□□□ -1.36
LCP1-201ENST00000323076 TLNRD1Q9H1K6 362 aa6.59□□□□□ -1.36
LCP1-201ENST00000323076 FKRPQ9H9S5 495 aa6.59□□□□□ -1.36
LCP1-201ENST00000323076 TAS2R3Q9NYW6 316 aa6.59□□□□□ -1.36
LCP1-201ENST00000323076 ADAM28Q9UKQ2 775 aa6.59□□□□□ -1.36
LCP1-201ENST00000323076 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.36
LCP1-201ENST00000323076 CHST2Q9Y4C5 530 aa6.59□□□□□ -1.36
LCP1-201ENST00000323076 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa6.59□□□□□ -1.36
LCP1-201ENST00000323076 COL1A2P08123 1366 aa6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms